Город Пярну – административный центр Пярнуского уезда, являющийся отдельным самоуправлением, не входящим в состав какой-либо волости (в Эстонской Республике до 1940 года являлся городом центрального подчинения, в Эстонской ССР – город республиканского подчинения, в 1952-1953 годах – центр Пярнуской области).

На официальном сайте органов самоуправления Пярну сказано, что
"квадратный флаг Пярну с геральдическим крестом впервые описан в XVII веке. Современный дизайн флага Пярну (который был разработан комиссией Союза городов Эстонии вместе с флагами других городов Эстонии) был принят городским собранием в 1934 году и начал использоваться на следующий год. Дизайн флага с крестом на синем поле основан на гербе города. Для избежания сходства со шведским флагом был взят предыдущий вариант герба, т.е. с серебряным крестом».

Эстонский историк Илмар Эрмус (Ilmar Ermus) в своей статье «Средневековые городские печати Эстонии» («Eesti keskaegsed linnapitsatid») упомянул, что при утверждении в 1930-х годах флага Пярну историческая комбинация чёрного и белого цветов на его флаге, к которой плохо относилась часть эстонцев, была заменена на комбинацию синего и белого цветов из шведских времён. Возможно, флагом торговых судов Пернова, который был членом Ганзейского союза, был чёрно-белый крестовый флаг, подобный флагу Риги XIV века (чёрный с белым прямым крестом).

В подготовленном к подписанию в июне 1940 года проекте указа президента Эстонской Республики флаг Пярну был описан следующим образом:

"Флаг города Пярну – синий флаг с северным белым крестом, верхний конец креста перпендикулярен верхнему краю флага и крестовины доходят до краёв флага. Синие и белые полосы на флаге равны 1/3 ширины флага. Длина синих полос от древка до креста равна 3/12 общей длины флага, от креста до свободного края флага – 7/12 общей длины флага".

Как и у флагов других городов Эстонии, в проекте указа предполагалось установить отношение ширины и длины флага как 1:2 и нормальный размер 110х220 см. В связи с начавшейся 16 июня 1940 года советизацией Эстонии указ не был подписан. В Эстонской ССР флаг Пярну не использовался.

Описанный в проекте указа президента 1940 года флаг был утверждён в 1993 году и зарегистрирован в Государственной канцелярии Эстонской Республики без описания:

Использовано изображение с официального сайта Государственной канцелярии Эстонской Республики

В Уставе города Пярну (Pärnu linna põhimäärus), принятом Пярнуским городским собранием 19 апреля 2001 года решением №13, было сказано, что

"(3) Флаг города Пярну (эталонное изображение флага города Пярну утверждено Пярнуским городским собранием 17 апреля 1997 года решением №25 "Символы города Пярну") – на синем северный белый крест. Отношение ширины и длины флага как 5:8 и нормальный размер 1000х1600 мм"

На официальном сайте органов самоуправления Пярну сказано, что «квадратный флаг Пярну с геральдическим крестом впервые описан в XVII веке. Современный дизайн флага Пярну (который был разработан комиссией Союза городов Эстонии вместе с флагами других городов Эстонии) был принят городским собранием в 1934 году и начал использоваться на следующий год. Дизайн флага с крестом на синем поле основан на гербе города. Для избежания сходства со шведским флагом был взят предыдущий вариант герба, т.е. с серебряным крестом».

В ныне действующем Уставе города Пярну (Pärnu linna põhimäärus), принятом Пярнуским городским собранием 18 сентября 2008 года решением №21 и вступившим в силу 1 октября 2008 года, повторено описание флага из Устава 2001 года и добавлена новая статья:

"(4) Вертикальный флаг (püstlipp) города Пярну – флаг города Пярну в вертикальном положении с изображением герба города Пярну в чёрном обрамлении. Отношение ширины к длине как 2:3, нормальный размер 600х900 мм"

В "Порядке разрешения использования герба, изображения флага и вертикального флага города Пярну" (Pärnu linna vapi, lipu kujutise ja püstlipu kasutamise loa väljastamise kord), принятом Пярнуским городским собранием 19 апреля 2010 года решением №6 и вступившим в силу 1 мая 2010 года, установлено, что вертикальный флаг города Пярну используется для украшения города в праздничные дни и во время общественных мероприятиях, в уменьшенных размерах в виде сувенирных вымпелов, при использовании командами и делегациями на парадных маршах.

Флаг «летней столицы»

В 2009 году на основе официального логотипа Пярну был принят и торжественно поднят 23 сентября «флаг летней столицы» (suvepealinna lipp) – белое полотнище с синей надписью «suvepealinn» («летняя столица») под синим логотипом Пярну и стилизованного изображения (под мазки кистью) солнца в виде жёлтой капли в широкой разомкнутой красной кайме.

Использовано сообщение сайта Parnu Postimees

Известен также появившийся позже вариант «флага летней столицы» с синим полотнищем и белыми логотипом и надписью.

Использована фотография с сайта Parnu Postimees