Самоуправление Алитусского района создано в 2001 году, включает 2 города (Симнас и Даугай), 3 местечка, 420 деревень и 6 хуторов, объединенные в 11 староств: Алитусское (Alytaus seniūnija, центр – Миклушенай (Miklusėnai), Аловеское (Alovės seniūnija), Бутримонисское (Butrimonių seniūnija), Даугайское (Daugų seniūnija), Крокялаукисское (Krokialaukio seniūnija), Мирославасское (Miroslavo seniūnija), Нямунайтисское (Nemunaičio seniūnija), Пивашюнайское (Pivašiūnų seniūnija), Пунясское (Punios seniūnija), Райтининкайское (Raitininkų seniūnija) и Симнасское (Simno seniūnija).

Администрация самоуправления расположена в г.Алитусе, который не входит в состав самоуправления Алитусского района.

Флаг самоуправления района представляет собой красное квадратное (5:6) полотнище с тонкой золотой каймой с трёх сторон и навершием в виде золотой лилии, в центре которого изображен утвержденный 7 августа 2001 года указом президента Литовской Республики герб самоуправления Алитусского района, созданный художником Арвидасом Каждайлисом (Arvydas Každailis) на основе печати города Олиты 1792 года ("В золотом поле из зеленой оконечности выходящие три зеленые лилии с красными цветами").

Литовский флаговед А.Слапсинскас (Audrius Slapsinskas) в ноябре 2003 года в международной веб-конференции "Flags of the World" сообщал также о виденном им флаге района с пропорцией сторон 1:2 и с желтым, а не золотым щитом.

Использованы материалы официального сайта администрации самоуправления Алитусского района