До 1940 года город назывался Ганчешты (Хынчешть, Хынчешты). В 1940—1965 - Котовское, с 1965 - город Котовск. В 1990 году возвращено историческое название Хынчешть.

Флаг города утвержден городским Советом 20 октября 2000 года, одобрен Национальной комиссией по геральдике 14 декабря 2000 года. Автор - Сильвиу Андриеш-Табак, художник - Марианна Шлапак.

Использованы материалы книги "SIMBOLURILE NATIONALE ALE REPUBLICII MOLDOVA"

Решением Национальной комиссии по геральдике от 25 марта 2015 года № 324-IV.01 флаг города Хынчешть подтвержден. Там же дано его описание:

Флаг города Хынчешть представляет собой прямоугольное синее полотнище (2:3), в середине которого желтый восстающий лев с красными языком и когтями, коронованный белой городской короной и держащий в правой передней лапе желтую секиру.

По сообщению Й. Паттке