Тараклийский район Молдавии существовал с 1940 года (в 60-х- годах был упразднён, но вновь образован в 1980 году). В 1999 году при административной реформе вся территория района вошла в Кагульский уезд, а к концу того же года - во вновь созданный Тараклийский уезд. В 2002 году вместо упразднённого уезда Тараклия воссоздан Тараклийский район.

Флаг района Тараклия, использовавшийся районом с начала 2000-х. Цвета повторяют цвета флага Болгарии (около 70% населения района - болгары). Тамга "Тарак" - гласный элемент.

В 2017 году были подготовлены к утверждению проекты герба и флага района - флагом предполагалось сделать бывший флаг уезда - зелено-бело-красный с тамгой. Но в итоге был выбран гербовый флаг.

Флаг района Тараклия утвержден решением районного совета Тараклия № 5/23 от 12 августа 2021 года и зарегистрирован в Общем гербовнике Республики Молдова Указом президента РМ от 22 ноября 2021 года № 241-IX "О регистрации герба и флага района Тараклия". Описание флага:

"Флаг представляет собой прямоугольное зеленое полотнище (2:3) со стенозубчатой оконечностью (1/3h), горизонтально пересеченной желтым и красным, обремененное в зеленом поле шествующим в левую геральдическую сторону серебряным леопардовым львом".

По информации В. Маркова