Пограничные войска СССР традиционно использовали зелёный цвет.

Зелёный цвет у пограничников имеет давние традиции. Уже в 1893 году для только что основанного корпуса пограничной охраны были введены светло-зелёные мундиры. В крейсерской флотилии корпуса использовались зелёные погоны, петлицы, канты и даже тельняшки в белую и зелёную полоску. С 1902 года зелёными стали папахи и фуражки пограничников.

Комплекс флагов пограничной флотилии утвержден Постановлением Президиума ЦИК СССР от 29 августа 1924 года "О флагах и вымпелах Союза ССР".

Кормовым флагом пограничной флотилии ОГПУ (1924) был зелёный флаг с уменьшенным флагом ВМФ в кантоне (он же являлся личным флагом Председателя ОГПУ).

Флаг Начальника отдела пограничной охраны ОГПУ (1924) повторяет кормовой флаг пограничной флотилии, но имеет треугольный вырез по вольной стороне, глубина выреза - 1/4 длины полотнища. Флаг упразднен 12 июня 1930 года.

Флаг командующего войсками ОГПУ округа, в ведении которого находятся суда пограничных флотилий ОГПУ, (1924) повторяет кормовой флаг пограничной флотилии, но имеет по нижней кромке красную полосу толщиной в 1/8 ширины флага. Флаг упразднен 12 июня 1930 года.

Постановлением ЦИК и СНК СССР от 12 июня 1930 года утвержден флаг Начальника Главного Управления Пограничной охраны ОГПУ и его помощников. Он повторял кормовой флаг судов погранфлотилии, но был дополнен тремя красными звездамиЮ, имеющими белую кайму.

Тогда же, 12 июня 1930 года, утвержден флаг Командующего войсками ОГПУ округа, командующего войсками ГПУ союзных республик и их заместителей. Он представлял собой кормовой флаг погранфлотилии, дополненный тремя белыми звездами.

Флаг Начальника управления Пограничной охраны и войск ОГПУ округа и его заместителя (1930) - кормовой флаг погранфлотилии, дополненный двумя белыми звездами.

Флаг Начальника Морской инспекции Главного управления Пограничной охраны и войск ОГПУ и его помощника (1930) - кормовой флаг погранфлотилии, дополненный двумя красными звездами, имеющими белую кайму.

Флаг Командира окружной морской базы судов ОГПУ округа (1930) - кормовой флаг погранфлотилии, дополненный одной белой звездой.

Вымпел судов пограничных флотилий ОГПУ был зелёным с вышеупомянутым флагом в головке. Длина вымпела в 55 раз (35 раз?) больше его ширины, длина выреза косиц равна 1/7 длины вымпела

Брейд-вымпел Начальника губернского отдела ОГПУ и Начальника части пограничной охраны округа, в ведении коих находятся суда пограничной флотилии, (1924) был белым с флагом пограничной флотилии в головке. Отношение общей длины вымпела к его ширине 11:2; длина выреза равна длине флага в головке. Брейд-вымпел упразднен 12 июня 1930 года и тогда же сделан брейд-вымпелом Командира отрядной морской базы судов ОГПУ.

Брейд-вымпел Начальника пограничной части губернского отдела ОГПУ, в ведении которого находятся суда пограничной флотилии, (1924) такой же, но зелёного цвета.

Брейд-вымпел Начальника пограничной флотилии ОГПУ (1924) такой же, но красный. Брейд-вымпел упразднен 12 июня 1930 года и тогда же сделан брейд-вымпелом Командира отряда судов ОГПУ.

Существовал также брейд-вымпел начальника отряда судов погранфлотилии Объединенного Государственного Политического Управления. Он был введен 29 августа 1924 года и упразднен Постановлением ЦИК и СНК от 21 ноября 1924 года.

Материалы Альбома флагов и вымпелов СССР, М, 1925, а также исследований В.А.Соколова

После смены флага ВМФ в 1935 году зелёный флаг с военно-морским флагом в кантоне был сначала кормовым флагом кораблей пограничной охраны НКВД СССР (Постановление ЦИК и СНК от 27 мая 1935 года "О военно-морских флагах СССР"), затем стал военно-морским флагом кораблей и судов пограничных войск СССР.

Система флагов пограничных войск КГБ СССР подтверждалась Постановлением Совета Министров СССР от 21 апреля 1964 года "О военно-морских флагах". Флаг пограничных кораблей СССР просуществовал до 1993 года.

Краснознаменный военно-морской флаг кораблей и судов пограничных войск был также зеленым с Краснознаменным военно-морским флагом СССР в крыже.

Кормовой гвардейский флаг пограничных кораблей ВМФ СССР (1950-1964) - зелёное полотнище с гвардейским военно-морским флагом в крыже.

Кормовой Краснознамённый гвардейский флаг пограничных кораблей СССР (1950-1964) - то же, но с орденом Красного Знамени поверх звезды.

С 1950 года вымпел пограничных кораблей СССР - зелёный, в головке флаг пограничных кораблей. С 1964 года - в головке - военно-морской флаг СССР.

Брейд-вымпел командира соединения кораблей пограничных войск был таким же, но более коротким: длина брейд-вымпела была в 5 раз больше ширины.

Флаг Народного Комиссара Внутренних дел (1935-1950) представлял собой зелёное полотнище с изображением в кантоне военно-морского флага СССР, звезда на флаге окружалась лавровым венком. Флаг утвержден Постановлением ЦИК и СНК от 27 мая 1935 года "О военно-морских флагах СССР".

Флаг Начальника пограничных войск КГБ при Совете Министров СССР (1964) - полотнище зеленого цвета, в крыже военно-морской флаг СССР, на котором звезда заменена изображением красного адмиралтейского якоря, на который наложена звезда, а вся композиция помещена в полувенок из лавровых листьев желтого цвета с развевающейся лентой белого цвета.

Флаг Начальника пограничных войск округа (1950-1993) повторял флаг судов пограничных войск, но в вольной части помещались две белых звезды.

На флаге командира соединения кораблей пограничных войск КГБ СССР (1950-1993) - одна звезда.

Флаг министра государственной безопасности (1950-1953) - зелёный, в крыже военно-морской флаг, где вместо звезды и серпа с молотом изображен герб СССР.

Председатель КГБ СССР (1964-1991) имел такой флаг: зелёное полотнище, в красном кантоне герб СССР.

Флаг поднимался на судах, где присутствовал Председатель КГБ.

Указом Президента СССР от 3 декабря 1991 г. N УП-2951 "Об утверждении Временного положения о Комитете по охране государственной границы СССР" было утверждено указанное Положение. В тексте Временного положения о Комитете по охране государственной границы СССР говорилось:

"19. Пограничные войска СССР имеют пограничный флаг, морской и авиационный пограничные флаги и опознавательные знаки, описание и порядок использования которых утверждаются Президентом СССР".

Комитет по охране государственной границы СССР просуществовал очень недолго...

Указом Президента СССР от 28 ноября 1991 г. №УП-2890 "Об утверждении Временного положения о Межреспубликанской службе безопасности" КГБ СССР был упразднен и вместо него была создана Межреспубликанская служба безопасности. В свою очередь,Указом Президента РСФСР от 19 декабря 1991 г. "Об образовании Министерства безопасности и внутренних дел РСФСР" Межреспубликанская служба безопасности, Министерство внутренних дел СССР, Министерства внутренних дел РСФСР и Агентство федеральной безопасности РСФСР были упразднены с реорганизацией в Министерство безопасности и внутренних дел РСФСР (существовало до 15 января 1992 года, 24 января 1992 года было создано Министерство безопасности Российской Федерации).