Штандарт (флаг) Президента Российской Федерации утверждён президентским Указом №319 от 15 февраля 1994 года. Штандарт (флаг) представляет собой квадратное полотнище из трёх горизонтальных полос: белой, синей и красной; в центре изображён золотом герб России (вариант без гербового щита). Штандарт обшит золотой бахромой, на древке укреплена серебряная скоба с выгравированными именем и годами правления президентов. Оригинал штандарта находится в служебном кабинете Президента РФ в Кремле. Прообразом штандарта Президента послужил вероятно флаг "царя Московского" петровских времён.

В 2007 году президента стал иногда сопровождать странного вида штандарт, не совсем соответствующий Федеральному конституционному закону о гербе РФ: вместо всадника-змееборца в нагрудном щитке у орла изображён Святой Георгий (с нимбом). Напомним, что в 1993 году всадник на щите был сознательно не назван Святым Георгием, отчасти из толерантности к многотысячной армии атеистов, мусульман, буддистов и других нехристиан, а отчасти из уважения к исторической преемственности - на древних русских монетах изображался именно всадник, князь, Святым Георгием он стал только в XVIII веке.

В 2009 году стали использовать штандарт президента, на котором всадник был перерисован в виде европейского рыцаря в латах, на коне - зеленый подседельник.

21 сентября 1995 года Министром Обороны одобрен эскиз флага Главнокомандующего Вооруженными Силами РФ (коим в России является Президент). Флаг повторяет рисунок Штандарта Президента, но имеет пропорции 2:3.