Флаг района Выхино-Жулебино повторяет композицию герба, утвержденного в 2002 году. На зеленом поле золотые лев с ветвью в пасти и лиса поддерживают золотую державу; глава щита лазуревая, отделенная от зеленого поля серебряной полоской, покрытой орнаментом. На сайте Управы района дается объяснение символики флага:
"Зеленое поле флага символизирует вотчины села Кусково - деревни Выхино и Жулебино, принадлежащие роду графов Шереметьевых. Синяя полоса и лента символизируют Кузьминские пруды. Фигура льва - деталь герба рода Шереметьевых - как символ власти, силы; фигура лиса - символ хитрости, дипломатии - характеризует управителя графских деревень Остеева А.Т., по прозвищу Жулеба (хитрец). "Содружество" льва и лиса, держащих Державу в своих руках - в данном случае как символ Университета Управления, расположенного на территории района. Серебряная глава в верхней части щита - фрагмент рисунка деревянной резьбой наличников домов деревень Выхино и Жулебино, давших название району".

Использованы материалы сайта Управы района Выхино-Жулебино

Символика муниципального образования Выхино-Жулебино утверждена Решением муниципального Собрания № 35 от 28 сентября 2004 года.

Обновленный флаг муниципального округа Выхино-Жулебино утвержден Решением от 23 января 2024 года № 6 "Об официальных символах (гербе и флаге) муниципального округа Выхино-Жулебино". В целом композиция флага не изменилась, но фигуры были перерисованы чуть в ином стиле.

2.1. Описание флага муниципального округа Выхино-Жулебино:
"Прямоугольное зеленое полотнище с отношением ширины к длине 2:3, на всю поверхность которого распространена композиция из герба муниципального образования, с заменой геральдических золота, серебра и лазури соответственно желтым, белым и синим цветами".

2.2. Обоснование символики (семантика) флага муниципального округа Выхино-Жулебино.
Флаг разработан на основе герба и повторяет его символику.
Зеленое поле флага символизирует вотчины села Кусково – деревни Выхино и Жулебино, принадлежащие роду графов Шереметьевых с XVI столетия.
Синяя полоса символизируют любимое место отдыха жителей – Кузьминские пруды.
Белая фигурная кайма – фрагмент рисунка деревянной резьбы наличников домов деревень Выхино и Жулебино, давших название району.
Лев с лавровой ветвью (в геральдике лев, стоящий в такой позе, называется львиный леопард) – символ власти и силы – фигура из герба рода Шереметьевых.
Лис – символ хитрости и дипломатии, отсылает к личности управителя графских боярину Остееву по прозвищу Жулеба (хитрец).
"Содружество" льва и лиса, силы и дипломатии, держащих Державу в своих лапах в гербе муниципального округа символизирует, расположенный здесь Государственный университет управления.
Также дополняют символику флага использованные цвета, имеющие свою традиционную символику:
Желтый цвет (золото) – как символ достатка, интеллекта, уважения, стабильности.
Белый цвет (серебро) – символ чистоты, совершенства, мира и взаимопонимания.
Зеленый цвет – символ жизни, возрождения и роста, в муниципальной геральдике часто отражает природные богатства местности.
Лазоревый (синий) цвет – символ чести, благородства, духовности, в муниципальной геральдике часто символизирует водные просторы.

Источник - сайт муниципального округа Выхино-Жулебино https://vihyno.org/