Муниципальное образование Пятигорский сельсовет создано в 2004 году и упразднено в 2020 году при преобразовании Предгорного муниципального района в Предгорный муниципальный округ.

Флаг Пятигорского сельсовета утвержден решением Совета депутатов Пятигорского сельсовета №68 от 10 марта 2006 года. Флаг внесён в Государственный геральдический регистр под №2531. Автор флага - И.Л.Проститов.

Флаг выполнен по мотивам герба: полотнище состоит из белых и зелёных шевронов (символизируют пять населённых пунктов в составе муниципального образования, а также название посёлка Пятигорского); у древка наверху два красных перекрещенных клинка, напоминающих об имевших здесь место летних кавалерийских лагерях.

По материалам книги Н.А.Охонько "Символы малой родины"

В тексте Положения о флаге символ описан так: "Флаг представляет собой зелёное полотнище, в зелёном и серебристом цвете поле которого - отображено цветом полотнище флага. Фигуры флага имеют следующее толкование: пять стропил символизируют пять гор и пять населённых пунктов; две червлённые шашки, обращённых вершинами к древку и скрещённые клинками вверх и вынесенные в крыж отображают историю возникновения пос.Пятигорский на базе летних лагерей кавалерийского полка и положение их в почётном месте указывает на то, что центром является пос.Пятигорский".

Геральдическим советом предложен такой вариант описания: "Прямоугольное полотнище зеленого цвета с отношением ширины к длине 2:3, несущее пять белых стропил шириной 1/10 длины флага, обращенных вершинами к древку. В крыже – две красные шашки, скрещенные клинками вверх".