Герб и флаг муниципального образования Шостьинское сельское поселение утверждены решением Совета депутатов Шостьинского сельского поселения № 55 от 18 августа 2021 года. Флаг внесен в Государственный геральдический регистр РФ под № 13726. Описание флага:

"Прямоугольное зеленое полотнище, воспроизводящее в центре композицию фигур из герба Шостьинского сельского поселения - желтый восьмиконечный православный крест, трилистный на трёх главных концах, внизу проросший в стороны и вверх двумя ветвями роз, на каждой из которых по четыре белых с желтым убором цветка над узкой бело-красно-белой горизонтальной полосой общей шириной в 1/12 длины флага, отстоящей от нижнего края полотнища на 1/10 ширины флага".

Крест обозначает Никольский Шостьенский ставропигиальный женский монастырь. Восемь цветков на ветках – число населенных пунктов поселения. Пояс (вместе с цветом полотнища) – цвета флага и мантии Патриарха (монастырь – патриаршее подворье).

Материалы геральдического архива В. Маркова