Флаг Аксубаевского муниципального района утвержден решением Представительного органа Аксубаевского муниципального района от 20 декабря 2005 года №20 и внесен в Государственный геральдический регистр Российской Федерации под №2172. Согласно тексту Положения о флаге:

"3. Описание и обоснование символики флага Аксубаевского муниципального района
3.1. Описание флага Аксубаевского муниципального района:
"Флаг Аксубаевского района представляет прямоугольное полотнище с отношением ширины к длине 2:3, разделённое по горизонтали на две равных полосы - зелёную и красную, с голубым треугольником у древка, занимающим (1/4) площади полотнища, с изображением жёлтого стилизованного солнца и трёх летящих к нему белых голубей".
3.2. Обоснование символики флага Аксубаевского муниципального района.
Флаг Аксубаевского района разработан на основе герба, который языком символов и аллегорий отражает культурные, исторические и экономические особенности района.
Три белых голубя соприкасающихся крыльями и окружающих солнце символизирует мирное и гармоничное сосуществование трёх народов на территории района: Чувашей, Татар и Русских. Белый цвет (серебро) - символ чистоты, совершенства, мира и взаимопонимания.
Жёлтое солнце показывает Аксубаевский район как самобытную землю богатую традициями, жители которой сохраняют память о своих предках и заботятся о потомках. Солнце - традиционный символ плодородия, истины, бескорыстия, славы.
Символика трёх частей полотнища многозначна:
- символизируют направления экономики района: нефть, хлеборобство, животноводство;
- поля показывают смену времён года и основанный на ней земледельческий годовой цикл; таким образом, подчёркивая сельскохозяйственную направленность районного производства.
Жёлтый цвет (золото) - символ урожая, богатства, стабильности, уважения и интеллекта.
Красный цвет - символ мужества, силы, труда, красоты.
Голубой цвет - символ чести, благородства, духовности.
Зелёный цвет - символ природы, здоровья, жизненного роста, возрождения.
3.3. Авторская группа:
Разработка флага произведена Геральдическим советом при Президенте Республики Татарстан совместно с Союзом геральдистов России в составе: Рамиль Хайрутдинов (Казань), Радик Салихов (Казань), Константин Мочёнов (Химки), Кирилл Переходенко (Конаково), Оксана Афанасьева (Москва)".

Материалы предоставлены К.Ф.Моченовым (Союз геральдистов России)