В 1888 году в составе Приморской области была создана Командорская округа с центром в селе Никольском. В 1902 году округа преобразована в уезд. В 1926 году на Командорских островах был создан Алеутский Туземный Совет, в 1932 год – Алеутский Тузсовет был переименован в Алеутский национальный район.
9 июня 2008 года при Администрации Алеутского муниципального района создана геральдическая комиссия для разработки проектов герба и флага района. В комиссию вошли: председатель Думы AMP Шпигальский С.Н.; хранитель фондов и научный сотрудник МУ «Алеутский краеведческий музей» Татаренкова Н.А.; главный специалист Никольского сельского поселения AMP по архиву и нотариату Кузеева Т.П.; заместитель директора по информационным технологиям, учитель МОУ «Никольская средняя общеобразовательная школа», представитель MOO «AHCAPKO» Вожикова С.В.; сотрудник ФГУ ГПБЗ «Командорский» Сирко М.П.; председатель Совета ветеранов Алеутского муниципального района Борисов К.И.; помощь верстке электронной версии оказал ведущий специалист по программному обеспечению при Администрации АМР Лукин А.В.; секретарем комиссии был назначен специалист администрации AMP по правовым вопросам Сергунин А.В. Возглавил комиссию Глава Алеутского муниципального района Извеков Н.Н. Комиссия осуществляла свою работу в тесной связи с "Союзом геральдистов России".
Собственный проект флага для Алеутского района был предложен Ильей Павловичем Вьюевым. Он предлагал поместить на фоне российского триколора Андреевский флаг, а в его центр поместить т.н. "алеутскую звезду".
Флаг Алеутского района утвержден решением Думы Алеутского муниципального района от 1 декабря 2008 года №163 и внесен в Государственный геральдический регистр РФ под №4522. Описание флага:
"Прямоугольное голубое полотнище с отношением ширины к длине 2:3, несущее вдоль верхнего края белый прямоугольный клин от верхнего угла у свободного края до середины полотнища у древка, и воспроизводящее фигуры из герба района, выполненные желтыми, красными, белыми и голубыми цветами".
Обоснование символики флага Алеутского МР.
Цвета и фигуры герба аллегорически и символически раскрывают национальные, этнографические и экономические особенности Алеутского района.
Охотник в национальных одеждах, сидящий в алеутской лодке - каяке и держащий традиционный для алеутов вид орудия охоты на морского зверя метательную дощечку с прикрепленным к ней гарпуном с тремя дополнительными стрелами - символически отражает особенности проживания и выживания титульного народа в непростых условиях северного побережья Дальнего Востока.
Тюлень - аллегория богатства здешних мест морским зверем, охота на которого, является основным видом занятий местного населения.
Алеутский район состоит из группы островов, основными из которых являются остров Медный и остров Беринга, открытый во время плавания Витуса Беринга - известного исследователя Дальневосточной части России и похороненного на острове, носящем его имя. Восьмиконечная звезда - так называемая "Роза ветров" - символ первооткрывателей, путешественников, людей с непростой судьбой, любителей приключений.
Командорские острова называют "страной ветров и туманов", что объясняется особенностями их расположения на стыке холодного течения Северного Ледовитого океана и теплого течения Куросио. Скошенная серебряная часть флага - аллегория этих туманов и снегов, покрывающих острова с ноября по апрель.
Голубой цвет (лазурь) - символ возвышенных устремлений, искренности, преданности, возрождения.
Белый цвет (серебро) - символ чистоты, открытости, божественной мудрости, примирения.
Желтый цвет (золото) - символ высшей ценности, величия, великодушия, богатства, урожая.
Красный цвет - символ труда, мужества, жизнеутверждающей силы и красоты, праздника - аллегорически символизирует тружеников района и их ратный труд.
Авторская группа:
руководитель проекта: Константин Моченов (Химки);
художник и компьютерный дизайн: Оксана Афанасьева (Москва);
обоснование символики: Вячеслав Мишин (Химки)".
По материалам статьи Н.А.Татаренковой "Алеутский район: история ... геральдической символики" и сайта Союза геральдистов России