Флаг района утвержден решением Собрания депутатов Аликовского района "О Гербе, флаге, эмблеме Аликовского района" от 27 июля 2007 года № 151. Автор - А.В. Данилов
"Флаг Аликовского района представляет собой прямоугольное полотнище с пропорциями сторон 5:8. Основной цвет флага белый, внизу полоса красного цвета, ограниченная волнистыми линиями желтого и синего цветов, выражающими образы нивы и рек Сорма и Вылы. На белом фоне флага находится условное изображение синего дерева с желтыми листьями, передающее образ сормовских лесов и символизирующее процветающий край. Сочетания белого, синего, желтого и красного обусловлены цветами флагов Чувашской Республики и Российской Федерации. Изображения флага и герба, символов района, гармонируют по цвету и стилю".

По материалам сайта правительства Чувашии (портрет Аликовского района)

Проект нового флага Аликовского района. Автор проекта В.А.Шипунов. Позже эта композиция стала флагом Ямашевского сельского поселения Чувашии.

По материалам сайта правительства Чувашии 2011

Герб и флаг Аликовского района утверждены Решением Собрания депутатов Аликовского района от 29 марта 2016 года № 62.

Обоснование символики герба Аликовского района:
В гербе района представлен богатырь, держащий руками молодой дуб, олицетворяя предание об Элеке – основателе этого края, который первым пришел в эти благодатные места, где кругом росли дубовые рощи.
Дуб с желудями, являясь древом жизни, древом плодородия, служит воплощением полной силы, стабильности, долголетия, крепости, мудрости.
Двенадцатилучевая звезда, имеющая 12 концов, обозначает 12 сыновей Элека, а также 12 сельских поселений, входящих в состав района.
Золото (желтый цвет) – цвет зрелых колосьев, урожая, символизирующий достаток, благородство, верность.
Зеленый цвет – символ плодородия, красоты природы.
Серебро (белый цвет) указывает на водные ресурсы района: Тенеевское озеро, реки Сорма и Выла, множество других мелких рек.
Красный – цвет жизни, радости, труда, мужества, олицетворяет выдающихся земляков, уроженцев этого края, являющихся гордостью республики и страны.
3.8. Авторская группа.
художник и автор идеи герба: Вадим Шипунов;
обоснование символики: Галина Шипунова;
компьютерный дизайн: Дмитрий Шипунов (все – Мариинский Посад);

По сообщению В. Маркова со ссылкой на сайт Правительства Чувашской Республики

Флаг внесён в Государственный геральдический регистр РФ под № 10962.

В 2022 году решено преобразовать муниципальный район в Аликовский муниципальный округ, процедура должна быть завершена к 1.01.2023 г. При этом как административно-территориальная единица Аликовский район сохраняется.