Крепость Арзамас заложена в 1552 году на месте древнего мордовского поселения. В 1954-1957 гг Арзамас был областным центром Арзамасской области. Ныне имеет статус городского округа.

Флаг города Арзамаса утверждён Решением Арзамасской Городской Думы от 17 ноября 2006 года №136 "Об установлении официального символа - флага города Арзамаса Нижегородской области" ("Арзамасские новости", №141(2275), 30.11.2006.). Согласно тексту Положения о флаге:

"2.1. Описание флага: "Флаг города Арзамаса представляет собой прямоугольное полотнище с отношением ширины к длине 2:3, воспроизводящее композицию герба города Арзамаса в желтом, красном и зеленом цветах".
2.2. Толкование символики флага:
символика флага соответствует гербу города, высочайше утвержденному 16 августа 1781 г. Указом Ея Императорского Величества самодержицы Всероссийской Екатерины II ("Полное собрание законов Российской Империи за 1619 - 1900 гг.", изд. С.-Петербург, 1900), и представляет собой щит геральдический в форме прямоугольника, основание которого равняется 8/9 высоты, выступает в нижней части острием и имеет закругленные нижние углы. На щите - в золотом поле два стропила, сходящиеся острием в центре, верхнее стропило - красное, нижнее - зеленое.
Черно-белое изображение герба: золотое поле изображается точками; красное верхнее стропило - вертикальными линиями, зеленое стропило - диагональными линиями.
Герб города Арзамаса утвержден постановлением мэра города от 19.11.1993 № 992 с изменениями, внесенными постановлением мэра города Арзамаса от 05.02.1997 № 43, внесен в Государственный геральдический регистр под номером 140.
Оборотная сторона флага является зеркальным отображением его лицевой стороны".

Решением Арзамасской городской Думы от 10 августа 2007 года №87 "О переходящем флаге города Арзамаса Нижегородской области" была учреждена почетная награда города Арзамаса - переходящий флаг города Арзамаса Нижегородской области - и утверждено Положение о нём. Переходящий флаг города Арзамаса - награда за заслуги в социально-экономическом развитии города, в обеспечении безопасности и жизнедеятельности населения города Арзамаса. Переходящим флагом могут быть награждены предприятия, организации и учреждения, являющиеся юридическими лицами, и иные коллективы, заслуживающие признания своими высокими результатами и достижениями. Описание переходящего флага города Арзамаса Нижегородской области:

"Переходящий флаг соответствует флагу города Арзамаса, утвержденному решением Арзамасской городской Думы №136 от 17.11.2006 г. Описание переходящего флага:
"Переходящий флаг города Арзамаса представляет собой прямоугольное полотнище с отношением ширины к длине 2:3, воспроизводящее композицию герба города Арзамаса в желтом, красном и зеленом цветах. Оборотная сторона переходящего флага является зеркальным отображением его лицевой стороны. На лицевой стороне переходящего флага размещена надпись: "За заслуги перед городом Арзамасом!".

По сообщению М.В.Ревнивцева со ссылкой на справочную правовую систему "Гарант"

Флаг Арзамаса внесен в Государственный геральдический регистр РФ под №2825.