Герб и флаг Баягинского наслега утверждены решением наслежного Совета депутатов от 17.12.2019 № 34. Описание флага:

"Прямоугольное полотнище с отношением ширины к длине 2:3, воспроизводящее композицию герба муниципального образования «Баягинский наслег» в синем, зеленом, желтом, белом и черном цветах".

Флаг внесен в Государственный геральдический регистр РФ под № 13053.

Материалы геральдического архива В. Маркова. Текст документа прислан В. Пермяковым