Положение о флаге МО "город Белогорск" утверждено Решением городского Совета народных депутатов №04/54 от 4 мая 2009 года (принято городским Советом народных депутатов 30 апреля 2009 года). Согласно тексту Положения:

"Флаг города Белогорск представляет собой прямоугольное полотнище с отношением ширины к длине 2:3, состоящее из двух горизонтальных полос: верхней зеленого цвета, шириной 2/3 ширины полотнища и нижней волнистой, синего цвета; в центре зеленой полосы - две равной высоты треугольной горы белого цвета (основания которых совпадают с линией деления полос полотнища), причем ближайшая к древку выходит в сторону древка из-за другой, над которыми три восьмилучевых звезды белого цвета в ряд."
2.2. Толкование символики ФЛАГА: Флаг города Белогорск разработан на базе герба, его основной фигурой стала Белая гора – обнажения светлого кварцевого песка на противоположном берегу реки Томь.
Лазоревый цвет символизирует реку Томь, вдоль которой вытянулся город.
Лазоревый цвет – символ чести, славы, преданности, истины, красоты, добродетели.
Восьмилучевые звезды взяты из областного герба и показывают принадлежность города к Амурской области.
Серебро- символ чистоты, мудрости, благородства, мира, взаимо - сотрудничества.
Зеленый цвет – символ весны, радости, надежды, жизни, природы, а также символ здоровья".

Рисунок и описание предоставлены А.Куприным ("БИАР", г.Москва)

Флаг Белогорска внесен в Государственный геральдический регистр РФ под №4911.