Флаг Березанского сельского поселения утвержден решением Совета муниципального образования Березанского сельского поселения Выселковского района №8 от 14 октября 2008 года. Флаг внесён в Государственный геральдический регистр под № 4489. Описание флага:

"Полотнище желтого цвета с отношением ширины к длине 2:3, несущее посередине многоцветную фигуру запорожского казака с пистолем, саблей, копьем и мушкетом. Казак изображен стоящим на зеленых глыбах, изображение которых примыкает к нижнему краю полотнища".

Обоснование символики:
Флаг разработан на основе герба, который языком символов и аллегорий отражает исторические, культурные и экономические особенности сельского поселения.
Своё название станица, а после и поселение получили в 1793 году, по повелению императрицы Екатерины II, в честь взятия черноморскими казаками крепости на острове "Березань" в период русско-турецкой войны 1768-1774 гг.
Основой герба и флага стала печать Березанского куреня конца XVIII века, изображающего запорожского казака в национальных одеждах, держащего в правой руке копьё, на поясе саблю, а в левой руке мушкет. Казак стоит на руине, в виде холма состоящей из зеленых глыб мурованных чёрным, аллегорически указывающей на остров Березань, на котором была разрушена до основания турецкая крепость.
Зелёный цвет символизирует жизнь, здоровье, надежду, возрождение.
Жёлтый цвет символизирует величие, богатство и процветание, прочность, достаток. А также жёлтый цвет аллегорически указывает на богатые пшеницей поля поселения.
Авторская группа:
идея герба: Владимир Нагаевский (Тихорецк), Михаил Шарунов (Краснодар);
Изображение и обоснование символики: Владимир Нагаевский (Тихорецк).

Материлы предоставлены А.Данильченко (г.Майкоп)