Флаг Бриньковского с.п. утверждён Решением Совета Бриньковского с.п. от 27 декабря 2011 года №140 "О флаге Бриньковского сельского поселения Приморско-Ахтарского района Краснодарского края". Флаг внесён в Государственный геральдический регистр РФ под № 7578. Согласно тексту Положения о флаге:

"2. Описание и обоснование символики флага Бриньковского сельского поселения
2.1. Описание флага Бриньковского сельского поселения гласит:
«Прямоугольное двухстороннее полотнище голубого цвета с отношением ширины к длине 2:3, окаймленного полосой малинового цвета шириной 1/10 длины полотнища с 25-ю желтыми о четырех лучах косвенными звездами. В середине полотнища - фигуры из герба Бриньковского сельского поселения - вверху два желтых колоса накрест, внизу две белых шашки накрест перекрещенных с колосьями, между колосьев вверху желтый наконечник стрелы».
2.2. Рисунок флага Бриньковского сельского поселения в многоцветном варианте приводится в Приложении 1 к настоящему Положению, являющемся неотъемлемой частью настоящего Положения.
2.3. Обоснование символики флага Бриньковского сельского поселения,
Станица Бриньковская, расположенная на берегу Бейсугского лимана, начинала свою историю с нескольких рыболовных хуторов, возникших в устье реки Бейсуг в первой половине XIX века. Название станицы связано с урочищем «Бринков», названному по имени Бринковского укрепления, выстроенному генерал-майором, кавалером ордена Святого Георгия Иваном Федоровичем Бринком, соратником А.В. Суворова, командиром Кубанского корпуса.
История и сегодняшний день поселения нашли отражение в его гербе.
Переплетенные колосья и шашки - символизируют связь боевого прошлого основателей укрепления и его сегодняшнего дня, поскольку предприятия Бриньковского сельского поселения специализируются на выращивании зерновых культур. Хлебный колос - символ достатка, единения и возрождения.
Пурпурная кайма щита - символ казачества, дань памяти о погибших при освоении Кубанских земель казаках. Звезды на кайме - аллегорически отражают 25 казаков основателей хуторов при урочище «Брынков (Бринков)», в дальнейшем объединившихся в станицу. Звезды - символ устремленности в будущее.
Наконечник стрелы - аллегория самолета-истребителя БИ-1, испытания которого проводил в 1942-43 годах летчик испытатель, Герой Советского Союза Григорий Яковлевич Бахчиванджи, родившийся 7(20) февраля 1909 года в станице Бриньковской. В станице установлен памятник Г.Я. Бахчиванджи. Наконечник стрелы - символ преодоления преград и достижения цели.
Голубой цвет (лазурь) - символ возвышенных устремлений, искренности, преданности, возрождения.
Малиновый цвет (пурпур) - символ власти, славы, почета, благородства происхождения, древности.
Желтый цвет (золото) - символ высшей ценности, величия, богатства, урожая. Белый цвет (серебро) - символ чистоты, открытости, божественной мудрости, примирения.
2.6. Авторская группа:
идея: Константин Моченов (Химки), Анатолий Раков (Краснодар), Татьяна Бутко (ст. Бриньковская);
художник и компьютерный дизайн: Ольга Салова (Москва); обоснование символики: Вячеслав Мишин (Химки).

По материалам геральдического архива В.Маркова - тексты взяты из открытых законодательных баз данных.