Флаг района утвержден решением Совета депутатов МО "Бугурусланский район" от 25 июня 2010 года №267 и внесен в Государственный геральдический регистр РФ под № 6349. Описание герба:

"Прямоугольное желтое полотнище с отношением ширины к длине 2:3, по вертикальным краям имеющее голубые полосы шириной в 1/5 длины полотнища; в центре полотнища изображен красный цветок из герба района, а на лазоревых краях изображен желтый колос со стеблем".

Обоснование символики флага Бугурусланского района.
В Бугурусланском районе находиться музей-усадьба русского писателя С.Т. Аксакова певца оренбургской природы, талант которого так дорог всем жителям района, Оренбуржья и России, автора известной сказки «Аленький цветочек». Красный цветок на флаге района, знакомый изгиб его листьев, перекликается с красным сердцем в гербе рода Аксаковых.
Бугурусланский район является сельскохозяйственным районом Оренбургской области. Основным видом деятельности сельхозтоваропроизводителей является возделывание зерновых культур. В связи с этим на гербе района – колосья пшеницы.
Происхождение названия Бугуруслан некоторые ученые связывают со словом «буг», в значении «урема - пойма, поросшая ивняком, осокорником, кустами вербы», или «река с широкой, затопляемой вешними водами лесистой поймой». Голубые края флага района – символически отражают не только это понятие, но и многочисленные пойменные озера, пруды и родники, расположенные на территории района.
Желтый цвет (золото) - символ прочности, богатства, величия, интеллекта и прозрения.
Голубой цвет (лазурь) – символ возвышенных устремлений, искренности, преданности, возрождения.
Красный цвет символ праздника, красоты, активности, мужества.
Авторская группа:
идея флага: Алексей Спиридонов (Бугурусланский район), Константин Моченов (Химки);
художник и компьютерный дизайн: Оксана Афанасьева (Москва);
обоснование символики: Вячеслав Мишин (Химки)".

По материалам сайта "Союза геральдистов России"