Флаг МО "Чердаклинский район" утверждён Решением от 18 мая 2006 года № 40 "Об официальной символике муниципального образования "Чердаклинский район". Согласно тексту Положения о гербе и флаге:

"7. Флаг муниципального образования "Чердаклинский район" является официальным символом муниципального образования и представляет собой прямоугольное полотнище с отношением ширины к длине 2:3, состоящее из двух равновеликих вертикальных полос: красного (у древка) и синего цветов.
В центре полотнища - фигуры герба муниципального образования "Чердаклинский район": летящая к древку чайка белого цвета и под ней две перекрещенных обнаженных сабли белого цвета.
Многоцветный рисунок флага муниципального образования "Чердаклинский район" помещен в приложении 3 к настоящему Положению.

По сообщению М.В.Ревнивцева

Флаг Чердаклинского района внесен в Государственный геральдический регистр РФ под № 2479.