Флаг Черемховского районного муниципального образования утвержден утвержден постановлением мэра района от 17 июня 2008 года №279 и внесен в Государственный геральдический регистр РФ под №4124. Описание флага:

"Прямоугольное голубое полотнище с отношением ширины к длине 2:3, несущее вдоль нижнего края черную полосу в 1/5 полотнища и посередине - желтое изображение бревенчатой башни, пересекающее границу полосы. Выше полосы по сторонам от башни изображены две желтые с черными ягодами ветви черемухи и ниже их - два желтых квадрата (углом вверх)".

Обоснование символики флага Черемховского района.
История Черемховского района началась с приходом русского казачьего отряда в середине XVII века и строительства первого острога (остерегающей - сторожевой крепости) на реке Белой, названного Бельским острогом. В дальнейшем на основе этого острога образовалось село Бельск, а затем появились и другие села. Здешние места богаты большими запасами каменного угля, магнезита, талька и других ископаемых. Все это нашло отражение на флаге района.
Бревенчатая башня - символизирует начало освоения здешних мест со строительства Бельского острога. Ветки черемухи гласно указывают на название района. Золотые ромбы - символ урожая, плодородия Черемховской земли, а черная оконечность - символизирует крупный угленосный слой, проходящий по территории района.
Голубой цвет символически отражает многие водные объекты, находящиеся на территории района, в том числе реки Ангара, Большая и Малая Белая, Онот, Урик и другие. Лазурь также символ возвышенных устремлений, искренности, преданности, возрождения.
Чёрный цвет символизирует благоразумие, мудрость, скромность, честность.
Желтый цвет (золото) - символ высшей ценности, величия, великодушия, богатства, урожая.
Авторская группа:
идея флага: Юрий Шапенков (с. Бельск, Черемховский район), Константин Моченов (Химки);
художник и компьютерный дизайн: Оксана Афанасьева (Москва);
обоснование символики: Вячеслав Мишин (Химки).

По материалам сайта "Союза геральдистов России"