Флаг Елецкого муниципального района утверждён Решением Елецкого районного Совета депутатов от 13 октября 2004 года № 69. Флаг внесен в Государственный геральдический регистр РФ под №1606.

"Флаг Елецкого района представляет собой прямоугольное жёлтое полотнище с отношением ширины к длине 2:3 с каймой, составленной из двенадцати равных чередующихся белых и зелёных частей (три у каждого края; у древка две зелёных); в центре фигуры герба района: вырастающая зелёная ель, перед которой красный с белыми рогами идущий олень".

Обоснование символики
Флаг района разработан на основе герба, в котором использован мотив исторического герба города Ельца. Фигуры Елецкого герба — красный олень и зелёная ель, указывают, что территория района является древней княжеской землёй — первое упоминание о Елецкой земле относится к XII веку. Кайма показывает район как достойное окружение города, поскольку история города Ельца и окружающих его земель неразрывна на протяжении многих веков.
Зелёные части каймы и жёлтый цвет полотнища подчёркивает сельскохозяйственную направленность района.
Жёлтый цвет (золото) — символ богатства, урожая, постоянства, великодушия.
Белый цвет (серебро) — символ совершенства, духовности, взаимопонимания.
Красный — сила, мужество, жизненная энергия, любовь и красота.
Зелёный — символ природы, здоровья, надежды.

Использована иллюстрация к статье К.Моченова и Ю.Коржика "О муниципальных флагах..." в журнале "Гербовед" №83