Флаг Елховоозерского СП утвержден решением Совета депутатов муниципального образования "Елховоозерское сельское поселение" №24 от 8 ноября 2013 года. Согласно тексту Положения о флаге:

Описание флага
"Прямоугольное двухстороннее полотнище с отношением ширины к длине 2:3, воспроизводящее фигуры герба муниципального образования "Елховоозерское сельское поселение" в белом, синем, красном и желтом цвете".
Обоснование символики флага Елховоозерского сельского поселения.
Флаг разработан на основе герба муниципального образования "Елховоозерское сельское поселение".
Флаг муниципального образования "Елховоозерское сельское поселение" языком символов и аллегорий гласно отражает название села Елховое Озеро, от которого произошло название муниципального образования "Елховоозерское сельское поселение". Село расположено в 24 км к северо-востоку от районного центра в долине реки Свияга. Названо по заросшему ольхой озеру. Основано в 1649 году, когда несколько семей ясашных татар из разных деревень Свияжского уезда переведены были "в государеву конную службу по городу Симбирску в слободу Елховку на вечное житьё".
Почему село называют Елховое Озеро, простонародно Елшанкой, а татары и чуваши совсем по иному - Кэшэ? По приходно-расходной книге 1667 года /стр. 50/ написано: " … в деревне Ольховой, Озерная тоже числилось 12 дворов целых, 3 двора без четы и 9 полудвориков, а ясаку взыскивалось по окладу с 19 дворов с полудвором". Видимо, было две деревни Ольховой еще и Озерная. Это подтверждается некоторыми преданиями, сохранившимися доныне. Например, южнее села, за садом и Бугурнинской речушки есть место под названием "Бака Яфрагы". Здесь небольшая возвышенность. При раскопке земли извлекаются монеты и домашние вещи, относящиеся к 1660-70 годам. Поэтому, можно допускать, что здесь первые "переселенцы" служилые татары некоторое время населялись и этот населенный пункт назвали "Озерной", так как здесь кругом озера.
Ветка ольхи и лазоревое (синее) поле говорит о названии Ольховое озеро, а количество листьев и сережек аллегорически показывает другие населенные пункты, входящие в состав муниципального образования "Елховоозерское сельское поселение": - села Кайсарово, Кундюковка, деревня Александровка, поселок Буденновка, разъезд Елховое.
Cимволика ольхи у разных народов многопланова. Древние племена верили в способность ольхи (ее веток, сучков) отгонять нечистые силы. Ветки ольхи втыкали в посевы ячменя, чтобы кроты не разрывали почву, а также клали под снопы, чтобы обезопасить от мышей. Иногда из ольхи строили колодезные срубы, чтобы вода в них не тухла.
Ветвь - символ возрождения, аллегорически показывает муниципального образования "Елховоозерское сельское поселение" как перспективный муниципалитет в Цильнинском районе.
Сообращенные журавли, гнездящиеся на болотах и берегах озер и держащие ветвь ольхи - символ созидания, взаимопонимания, дружбы и согласия.
Журавль - символ осторожности, мудрости и бдительности.
Червленая часть флага и серпы - фигуры из герба Цильнинского района, символизируя неразрывную связь двух муниципальных образований. Серп - символ крестьянского быта, символ плодородия в земледелии.
Синий цвет (лазурь) - символ чести, благородства, возвышенных устремлений; цвет воды и неба.
Золото - символ высшей ценности, величия, богатства, урожая.
Серебро - символ чистоты, совершенства и мира.
Красный цвет (червлень) - символ труда, мужества, жизнеутверждающей силы, красоты и праздника.
Авторская группа:
идея флага и обоснование символики: Константин Моченов (Химки);
художник и компьютерный дизайн: Ольга Салова (Москва).

Флаг внесен в Государственный геральдический регистр РФ под №8878

Материалы сайта Союза геральдистов России

Решением Совета депутатов МО "Елховоозерское СП" от 27 февраля 2014 года № 39 в решение от 8.11.2013 г. внесены некоторые изменения (касательно ответственности за надругательство над флагом).