Первый вариант флага сельского поселения утвержден Решением Совета депутатов от 15 ноября 2013 года № 3/16

2.1. Описание флага Фабричновыселковского сельского поселения: «Прямоугольное двухстороннее зеленое полотнище с отношением ширины к длине 2:3, несущее вдоль нижнего края полосу малинового цвета шириной 1/6 ширины полотнища. В центре зеленой части полотнища вплотную к малиновой части изображены два белых сообращенных дракона, из которых левый – без крыльев, держащих лапами желтую молодую яблоню с двумя белыми цветками, а в центре малиной части изображен желтый ткацкий челнок (все фигуры из герба Фабричновыселковского сельского поселения)».

Малиновый цвет (пурпур) – символ власти, славы, почета, благородства происхождения, древности.

Текст документа прислан В. Марковым.

Флаг Фабричновыселковского СП утвержден решением Совета депутатов муниципального образования Фабричновыселковское сельское поселение от 19 декабря 2013 года № 6/36 и внесен в Государственный геральдический регистр РФ под № 9172. В отличие от варианта ноября 2013 года нижняя полоса стала синей.

Описание флага:
"Прямоугольное двухстороннее зеленое полотнище с отношением ширины к длине 2:3, несущее вдоль нижнего края полосу синего цвета шириной 1/6 ширины полотнища. В центре зеленой части полотнища вплотную к малиновой части изображены два белых сообращенных дракона, из которых левый - без крыльев, держащих лапами желтую молодую яблоню с двумя белыми цветками, а в центре синей части изображен желтый ткацкий челнок (все фигуры из герба Фабричновыселковского сельского поселения)".

Обоснование символики флага Фабричновыселковского сельского поселения.
До революции одним из самых крупных "дворянских гнёзд" Сызранского уезда Симбирской губернии было село Самайкино, которое в настоящий момент входит в состав Фабричновыселковского сельского поселения. Среди его владельцев были известные российские роды: Романовы, Поливановы, Воейковы. Наиболее известно было дворянское поместье (усадьба) Ивана Фёдоровича Воейкова. По распоряжению Ивана Федоровича крепостные обустроили на реке Томышовке глубокий пруд, поставили мукомольную мельницу, кирпичный, черепичный и сахарный заводики. В начале XVIII века рядом с прудом (центр п. Фабричные Выселки) Воейков устроил первую в здешних местах суконную фабрику, переведя мастеров из подмосковного имения Аннино.
Старший сын Ивана Фёдоровича Александр Иванович - один из крупнейших географов и метеорологов-климатологов России. Младший сын Ивана Фёдоровича Дмитрий Иванович занимался усадьбой. С его имением связано зарождение в России асфальтового производства. В 1875 году он построил один из первых в России асфальтовый завод в селе Батраки под Сызранью. За превосходное качество, асфальт с клеймом "Братья Воейковы" в 1878 году получил медаль на Всемирной выставке в Париже. После смерти Дмитрия Ивановича его дети вернулись в Санкт-Петербург. Старший сын Александр Дмитриевич пошёл по стопам своего дяди профессора Александра Ивановича Воейкова и после окончания Петербургского университета вернулся в Самайкинское имение, чтобы осуществить свою мечту - устроить плодовый питомник. Он проводил опыты по акклиматизации плодовых деревьев и кустарников, активно участвовал во всероссийских съездах и выставках, переписывался и обменивался семенами с И.В. Мичуриным. После революции семья Воейковых вынуждена была навсегда покинуть усадьбу, оставив в наследство потомкам возведенные корпуса ткацкой фабрики, школу, питомник, получившие всероссийскую известность.
Вся символика флага Фабричновыселковского сельского поселения связана с родом Воейковых, многие представители которых внесли существенный вклад в развитие и процветание ульяновской (симбирской) земли:
- два дракона на зеленой части полотнища - часть герба рода Воейковых, что символизирует связь прошлого с настоящим;
- цветущая яблоня в лапах драконов - символизирует садовый плодопитомник, действующий по настоящее время, заложенный Александром Дмитриевичем Воейковым, давший толчок к устройству новых садов по всей округе;
- ткацкий челнок - символ бывшей ткацкой фабрики, основанной Иваном Федоровичем Воейковым.
Зелёный цвет - символ сельского хозяйства Фабричновыселковского сельского поселения, символ весны, жизни, здоровья.
Синий цвет (лазурь) - символ возвышенных устремлений, искренности, преданности, возрождения.
Желтый цвет (золото) - символ высшей ценности, величия, богатства, урожая.
Белый (серебро) - символ совершенства, мира и взаимопонимания.
Авторская группа:
Идея: Константин Моченов (Химки).
Художник: Оксана Фефелова (Балашиха), Анна Гарсия (Москва).
Компьютерный дизайн: Анна Гарсия (Москва).
Обоснование символики: Вячеслав Мишин (Химки).

По материалам сайта Союза геральдистов России. Текст документа прислан В. Марковым.

В описании флага 2013 года ошибочно упомянут малиновый цвет (коего на самом деле на флаге нет). Необходимые исправления в решение о флаге внесены Решением Совета депутатов МО Фабричновыселковское СП о т23 июля 2018 года № 77/205. Уточненное описание флага:

"Прямоугольное двухстороннее зеленое полотнище с отношением ширины к длине 2:3, несущее вдоль нижнего края полосу синего цвета шириной 1/6 ширины полотнища. В центре зеленой части полотнища вплотную к синей части изображены два белых сообращенных дракона, из которых левый – без крыльев, держащих лапами желтую молодую яблоню с двумя белыми цветками, а в центре синей части изображен желтый ткацкий челнок (все фигуры из герба Фабричновыселковского сельского поселения)"

По сообщению В. Пермякова