Флаг МО "город Харабали" утверждён Решением Совета муниципального образования "Город Харабали" от 16 мая 2006 года № 108 "Об утверждении Положения о флаге муниципального образования "Город Харабали" и эскиза флага".

Флаг Города Харабали представляет собой прямоугольное полотнище в отношении ширины к длине 2:3, воспроизводящее композицию герба Города Харабали в зелёном, синем и жёлтом цветах, внесённого в государственный геральдический регистр Российской Федерации с присвоением регистрационного номера 658.
Допускается изображение герба на флаге в одноцветной версии, согласно пункту 2.5 Положения о гербе муниципального образования «Город Харабали». Изображение герба на флаге должно составлять 1/4 часть полотнища флага.

После получения замечаний от Геральдического совета при Президенте Российской Федерации описание флага было уточнено Решением Совета муниципального образования "Город Харабали" от 6 июня 2006 года № 123 "О внесении изменений в решение Совета муниципального образования "Город Харабали" от 16.05.2006 г. № 108":

Флаг Города Харабали представляет собой прямоугольное полотнище в отношении ширины к длине 2:3, воспроизводящее композицию герба Города Харабали в зелёном, синем и жёлтом цветах, внесённого в государственный геральдический регистр Российской Федерации с присвоением регистрационного номера 658.

По сообщению В. Пермякова. Рисунок реконструирован "Вексиллографией" по описанию.

Флаг Харабали внесен в Государственный геральдический регистр РФ под № 2475.