Флаг района утверждён Решением Совета народных депутатов Кантемировскою муниципального района от 18 июля 2007 года №364 и внесён в Государственный геральдический регистр РФ под №4273.

"Прямоугольное полотнище с соотношением сторон 2:3, разделённое по горизонтали на шесть неравных полос — чередующихся вверху три синих и две белых в 1/20 ширины полотнища каждая и красную в 3/4 ширины полотнища; на красной полосе посередине — жёлтая фигура особой формы из герба района".