Флаг Колгуевского сельсовета утверждён Решением Совета депутатов МО "Колгуевский сельсовет" НАО от 28 сентября 2013 года №4 от 29 августа 2013 года. [в документе Минюста ошибочно указана дата утверждения 28 сентября 2013 года] Флаг внесен в Государственный геральдический регистр РФ под № 8643.

2.1. Описание флага Колгуевского сельсовета:
«Прямоугольное двухстороннее полотнище голубого цвета с отношением ширины к длине 2:3, с воспроизведенными на нем фигурами из герба Колгуевского района, вы-полненными белым, голубым, малиновым и черным цветом».
2.2. Рисунок флага Колгуевского сельсовета приводится в приложении 1 к настоящему Положению, являющемся неотъемлемой частью настоящего Положения.
2.3. Обоснование символики флага Колгуевского сельсовета.
Остров Колгуев, составляющий всю территорию Колгуевского сельсовета и давшего ему свое имя, имеет форму близкую к кругу. Белый круг в центре полотнища – аллегория территории сельсовета.
Волнистые клинья, сходящиеся к центру круга – аллегория холмисто-грядового релье-фа в центральной части острова. Доминирующими формами рельефа острова являются до-лины рек, радиально расходящиеся от центра к берегам острова.
Остров был открыт поморами в XIII-XIV веках. Длительное время оставался необитае-мым. Первые ненцы появились на острове в начале XIX века. Традиционными видами хозяй-ственной деятельности населения острова являются оленеводство, морской зверобойный промысел, охота, рыбная ловля. В настоящее время оленье стадо составляет около 6000 го-лов. Это символически отражено в гербе сельсовета фигурой называемой местным населени-ем «оленьи рога». Разведением оленей занимаются две бригады, что на флаге сельсовета по-казано двумя более широкими лазоревыми клиньями.
Черная часть нижнего клина, как бы вытекающая из круга – символ открытого в 1982 г. в восточной части острова Песчаноозерского нефтяного месторождения, на котором в 1987 г. началась опытно-промышленная добыча нефти. Одновременно начато поисково-разведочное бурение в других частях острова. Добытая нефть вывозится танкерами в города Мурманск и Архангельск.
Голубой цвет (лазурь) – символ возвышенных устремлений, искренности, преданности, возрождения.
Белый цвет (серебро) – символ чистоты, открытости, божественной мудрости, прими-рения.
Малиновый цвет (пурпур) – символ славы, власти, древности происхождения, достоин-ства.
Черный цвет символизирует благоразумие, мудрость, скромность, честность.
2.6. Авторская группа.
Идея: Константин Моченов (Химки), Николай Майков (пос. Бугрино).
Художник: Оксана Афанасьева (Москва).
Компьютерный дизайн: Оксана Афанасьева (Москва), Анна Гарсия (Москва).
Обоснование символики: Вячеслав Мишин (Химки).

Использованы материалы сайта ГЕРАЛЬДИКА.РУ, архива В. Маркова