В 1938 году на основе пос.Калининский был образован город Калининград. Для отличия от прибалтийского Калининграда его часто неофициально называли "подмосковный Калининград". В 1996 году город получил новое имя - Королёв.

Флаг Королева утверждён Решение Совета депутатов муниципального образования "Город Королев" Московской области от 7 декабря 2005 г. N 102/600 "О флаге муниципального образования "Город Королев". Флаг внесен в Государственный геральдический регистр Российской Федерации под №3080.

"3. Описание и обоснование символики флага города Королева
3.1. Описание флага города Королева:
Флаг города Королева представляет собой синее прямоугольное полотнище с отношением ширины к длине 2:3, несущее вдоль нижнего края белую (вверху) и красную полосы (соответственно 1/20 и 1/7 ширины полотнища), а над полосами со смещением к древку воспроизведенные белыми и желтыми цветами основные фигуры герба: земной шар в окружении стенных зубцов, орбиты космического корабля и звезд.
3.2. Обоснование символики флага города Королева.
За основу флага взят герб города, созданный с учетом герба города Калининграда (переименован в г. Королев в 1996 г.), утвержденный 10 июня 1988 года 5-й сессией 20 созыва Калининградского городского Совета народных депутатов.
На флаге языком символов и аллегорий отражено развитие города, связанное со становлением космической промышленности, робототехники, электронного приборостроения.
Королев - один из крупнейших научно-производственных центров Московской области. Развитие комплекса началось в 1950-х годах и впоследствии объединило ряд предприятий города и Центр управления полетами. Здесь трудился выдающийся ученый и конструктор, академик С.П. Королев, именем которого и назван город, а также такие известные ученые, как А.М. Исаев, М.К. Янгель, В.П. Глушко.
Здесь был разработан и создан целый ряд уникальных космических аппаратов, включая первый искусственный спутник Земли (ИСЗ). В Королеве проводятся исключительные научно-технические исследования и разработки в области освоения космоса, ставшие залогом широкой известности города как в России, так и за рубежом.
Земной шар, окруженный звездами и изображением орбиты космического корабля, - символ выдающихся достижений жителей города в космическом машиностроении. Шестерня, изображенная геральдической фигурой - стенозубчато изломанной замкнутой золотой нитью, символизирует огромный научно-технический потенциал предприятий города.
Аллегорическое изображение перфоленты белой полосой - символ телеметрии, электронного приборостроения, измерительной техники и ЦУПа, созданного на базе этой техники.
Желтый цвет (золото) - символ богатства, стабильности, уважения и интеллекта.
Белый цвет (серебро) - символ чистоты, совершенства, мира и взаимопонимания.
Голубой цвет - символ чести, достоинства, возвышенных устремлений; в гербе города также символизирует небо и космическое пространство.
Красный цвет - символ труда, силы, мужества, красоты; подчеркивает особые заслуги рабочих, инженеров, служащих и ученых в развитии многочисленных государственных космических программ.
3.3. Авторская группа:
идея флага: Ренат Бубнов (Королев);
геральдическая доработка: Константин Моченов (Химки);
обоснование символики: Олег Агафонов (Москва), Кирилл Переходенко (Конаково);
компьютерный дизайн: Оксана Афанасьева (Москва)".

Использованы материалы сайта Союза геральдистов России, а также правовой справочной базы "Гарант"