Сельское поселение существовало до 2017 года, когда все муниципальные образования Истринского муниципального района были объединены в городской округ Истра. На территории муниципального образования было 25 деревень, центр - деревня Кострово.

Флаг Костровского СП утвержден Решением Совета депутатов сельского поселения Костровское от 13 августа 2010 года № 22/8 и внесен в Государственный геральдический регистр РФ под № 6734 Согласно тексту Положения о флаге:

"2.1. Описание флага сельского поселения Костровское:
"Прямоугольное двухстороннее полотнище с отношением ширины к длине 2:3, состоящее из двух равных горизонтальных полос голубой и красной, и воспроизводящее фигуры из герба поселения: желтое выходящее сверху солнце, и белая подкова, увенчанная желтой короной, внутри подковы – желтый костер, языки пламени которого пробиваются сквозь подкову".
2.2. Обоснование символики флага сельского поселения Костровское.
Первое известное упоминание о деревне Кострово (административный центр одноименного сельского поселения) относится к 1578-1579 гг.
В XVI-XVII вв. в царских конюшнях Московского государства служило значительное число конюхов - стремянных, стряпчих и стадных, многие из которых были владельцами вотчин и поместий. Часть так называемых «конюшенных сел», имевшихся и на Истринской земле (в том числе и в Кострово), использовалась для прокормления царских, стрелецких и рабочих лошадей. Серебряная подкова (как атрибут конской утвари), увенчанная царской короной, символизирует славное прошлое. Подкова является символом счастья, удачи.
Костер является гласным символом, указывающим на название поселения. Костер – символ борьбы с тьмою, символ тепла, спасения. Переплетение языков пламени костра и подковы – аллегория тесной связи настоящего и прошлого сельского поселения Костровское.
Выходящее сияющее солнце символизирует неразрывную историческую связь сельского поселения Костровское с Истринским районом: солнце – фигура флага Истринского муниципального района.
На территории Кострово стоят два обелиска: памятник землякам, погибшим в годы Великой Отечественной войны, и памятник воинам, защищавшим Кострово и близлежащие деревни в ноябре - декабре 1941 г. Красный цвет – символ мужества, жизнеутверждающей силы и красоты, праздника, труда.
Голубой цвет (лазурь) - символ возвышенных устремлений, искренности, преданности, возрождения.
Желтый цвет (золото) – символ высшей ценности, величия, великодушия, богатства, урожая.
Белый цвет (серебро) – символ чистоты, ясности, открытости, божественной мудрости, примирения.
2.3. Авторы флага:
идея флага: Константин Моченов (Химки), Сергей Янов (Малаховка);
художник и компьютерный дизайн: Ирина Соколова (Москва);
обоснование символики: Вячеслав Мишин (Химки).

По материалам сайта "Союза геральдистов России" и справочной правовой базы "Гарант"