Флаг Краснопартизанского района утвержден решением Собрания депутатов Краснопартизанского муниципального района от 30 июня 2010 года №45 и внесен в Государственный геральдический регистр РФ под №6364. Описание флага:

"Прямоугольное двухстороннее полотнище с отношением ширины к длине 2:3, воспроизводящее композицию герба района в белом, красном, желтом и зеленом цвете".

Обоснование символики флага Краснопартизанского муниципального района.
Флаг разработан на основе герба, который языком символов и аллегорий отражает экономические и природные особенности Краснопартизанского муниципального района.
Район, образованный в 1935 году, расположен на Сыртовской степной равнине в засушливой зоне Заволжья, однако создание комплекса сооружений по внедрению орошаемого земледелия дало превосходные результаты. Главным достижением в создании оросительной системы стало создание Саратовского оросительно-обводнительноко канала им. Алексеева, первые насосные станции которого заработали в 1972 году. Канал обеспечивает волжской водой одиннадцать районов Саратовской области и поддерживает сеть водохранилищ, необходимых для развития земледелия. Деление поля на красную и серебряную (водная гладь) части образно показывает берег канала и символизирует его огромное значение в жизни района. Символику гидросооружений дополняет волнистая оконечность переменных цветов - аллегория плотин и созданных людьми многочисленных водохранилищ.
Зерновое сельское хозяйство, как основа экономики района, отражена двумя колосьями - зеленым и золотым, аллегорически показывающими полный цикл выращивания сельскохозяйственных культур.
Во флоре Краснопартизанского муниципального района имеется ряд редких растений, занесенных в Красную книгу, но особой известностью и популярность пользуется тюльпан Геснера (Шренка). Цветы тюльпанов в гербе показывают не только любимый жителями цветок, но и образно отражают природное разнообразие района.
Золото - символ урожая, богатства, стабильности, уважения, интеллекта, солнечного тепла.
Серебро - чистоты и совершенства, мира и взаимопонимания; серебро - цвет прозрачной воды многочисленных водоемов района.
Красный цвет - символ мужества, силы, красоты, труда, праздника, также указывает на название района - Краснопартизанский.
Зеленый цвет - символ природы, здоровья, молодости, жизненного роста.
Авторская группа:
идея флага: Константин Моченов (Химки), Кирилл Переходенко (Конаково);
художник и компьютерный дизайн: Ирина Соколова (Москва);
обоснование символик: Кирилл Переходенко (Конаково)".

Материалы сайта Союза геральдистов России