Флаг сельского поселения Кубанское утвержден решением № 35 Совета Кубанского сельского поселения Апшеронского района от 1 июля 2015 года и внесен в Государственный геральдический регистр Российской Федерации под № 10448.

Описание флага:
«Прямоугольное полотнище с отношением ширины к длине 2:3, воспроизводящее композицию герба Кубанского сельского поселения Апшеронского района в синем, зеленом, белом, жёлтом, чёрном и красном цветах».
Обоснование символики герба и флага.
Герб и флаг языком символов и аллегорий отражают исторические, культурные и экономические особенности сельского поселения.
Синий цвет полотнища символизирует чистое небо, честь, искренность, добродетель, возвышенные устремления.
Зелёная часть полотнища символизирует красоту окружающей природы, разнообразные деревья и кустарники горных склонов поселения, надежду, возрождение, молодость.
Белая зазубренная диагональная полоса аллегорически указывает на горные реки, протекающие через земли Кубанского сельского поселения. Зазубренная диагональная полоса напоминает пилу, аллегорически указывающую на деревоперерабатывающие предприятия.
Белый цвет – символ мира, мудрости и ясности.
Населённые пункты поселения расположены среди лесов с разнообразными деревьями, целебными травами, грибами и ягодами. Одним из дополнительных заработков местных жителей является сбор кизила, который произрастает в окрестных лесах, на что аллегорически указывает стилизованное изображение куста кизила. Собранные в звезду листья и ягоды аллегорически говорят об общности интересов жителей Кубанского сельского поселения. Плоды символизируют молодое поколение. Количество листьев и ягод аллегорически указывает на шесть населённых пунктов в составе сельского поселения. Кизил – символ здоровья, силы и молодости.
Красный цвет символизирует труд, красоту и праздник.
Орёл - символ храбрости, силы, мужества и свободы. Изображение орла указывает на то, что данная птица обитает на территории Кубанского сельского поселения.
Дубовая ветвь символизирует воинскую славу и доблесть казаков, осваивавших эти земли. Изображение ветви также указывает на дубовые леса - гордость поселения.
Изображение казачьей шашки указывает на основателей населённых пунктовКубанского сельского поселения – казаков кубанских казачьих полков.
Золото (жёлтый цвет) символизирует процветание, достаток, стабильность, почёт и уважение.
Авторская группа:
идея и изображение В. Нагаевский (Тихорецк);
обоснование символики: В. Нагаевский и Н. Нагаевская (Тихорецк).

Материалы предоставлены "Геральдикуму" М.Шаруновым