Флаг МО "Курагинский район" утвержден решением районного Совета депутатов от 17 марта 2003 года № 18-78р и внесён в Государственный геральдический регистр под №1174. Описание флага:

"Флаг Курагинского района представляет собой красное прямоугольное полотнище с соотношением ширины к длине 2:3, несущий развернутую гербовую композицию: жёлтые меч и ель и белый опрокинутый вилообразный крест, нижние плечи которого упираются в углы флаг".

Обоснование символики флага Курагинского района.

В основу композиции флага положены исторические, географические, природные особенности Курагинского района.
Курагинский район образован в 1924 году путем слияния Курагинской, Поначевской, Шалаболинской части Имисской и Кочергинских волостей. Центр района - поселок Курагино, ведет свою историю с 1626 г. (Хурага-тура), название получил по имени основателя, кыргызского князя Кураги (Енисейские кыргызы - предки современных хакасов).
Вилообразный крест отражает географическое расположение места, где по преданиям на стыке рек Амыл и Казыр в реку Туба при подписании в начале XVIII в. договора о присоединении Тубинского княжества к России, Тубинский князь подарил кинжал воеводе Абаканского острога Конону Симонову.
Меч в ножнах - символ защиты территории от набегов монгольских ханов.
Нижняя часть флага, образованная плечами креста, аллегорически показывает курганы, где были обнаружены захоронения и оружие бронзового века.
Белый цвет (серебро) - символ совершенства, благородства, чистоты, веры, мира.
Ель говорит о разнообразии и богатстве природных ресурсов района.
Жёлтый цвет (золото) символизирует богатство, справедливость, уважение, великодушие.
Красный цвет символизирует храбрость, мужество, красоту и труд.
Авторская группа: идея флага: Елена Степкина (с. Ирбейское Красноярского края), Константин Мочёнов (Химки), Владимир Дюков (Красноярск), компьютерный дизайн: Юрий Коржик (Воронеж).

Использованы материалы сайта Союза геральдистов России