Флаг Курчанского сельского поселения утвержден решением Совета Курчанского сельского поселения от 15 января 2010 года №40 и внесен в Государственный геральдический регистр РФ под №5844. Описание флага:

"Прямоугольное желтое полотнище с отношением ширины к длине 2:3, с изображением фигур герба Курчанского сельского поселения: красной амфоры с вытекающими двумя голубыми струями, соединяющимися с голубой волнистой полосой идущей вдоль нижнего края (габаритной шириной в 1/4 ширины полотнища), на которой изображен судак белого цвета. Над амфорой расположена зеленая виноградная лоза с пятью малиновым гроздьями винограда".

Обоснование символики флага Курчанского сельского поселения.
Флаг разработан на основе герба Курчанского сельского поселения.
Основание станицы Курчанской, её история тесно связана с заселением Кубани и, в частности, Таманского полуострова Черноморскими казаками. По указу императрицы Екатерины II казаки переселялись на Тамань "границу держати", то есть для охраны новой южной границы Российской империи.
Переселившиеся казаки организовали сторожевую охрану границы не только по течению реки Кубани, но и по берегам многочисленных рукавов и речек, впадающих в Кубань, в том числе реки Курки, протекающей по территории поселения.
Символика фигур флага многозначна:
- два потока воды, вливающиеся в волнистую полосу, символизируют две реки: Кубань (большой поток) и Курка (малый поток) впадающие в Азовское море (волнистая голубая оконечность);
- виноградная лоза символ плодородия, развитого земледелия, виноградарства и виноделия;
- виноград - традиционный символ гостеприимства и радушия на флаге символизирует благоприятную южную природу поселения, популярную среди отдыхающих, приезжающих из разных уголков нашей страны;
- амфора аллегорически показывает расположение Курчанского сельского поселения на Таманском полуострове - месте известном еще с античных времен, именно здесь по представлениям древних греков Европа граничила с Азией.
- судак указывает на развитый среди местных жителей рыболовный промысел.
Желтый цвет (золото) - символ урожая, богатства, стабильности, уважения, солнечного тепла и энергии.
Голубой цвет - символ чести, духовности, возвышенных устремлений
Красный цвет - символ силы, мужества и доблести, труда, красоты и праздника.
Малиновый цвет (пурпур) - символ благородства, славы, достоинства, древности происхождения.
Зеленый цвет - символ природы, здоровья, молодости, жизненного роста.
Авторская группа:
идея флага: Константин Мочёнов (Химки), Анатолий Раков (Краснодар);
художник и компьютерный дизайн: Оксана Фефелова (Балашиха), Оксана Афанасьева (Москва), Ирина Соколова (Москва);
обоснование символики: Кирилл Переходенко (Конаково).

Использованы материалы сайта Союза геральдистов России