Флаг Кувакинского сельского поселения утверждён Решением Собрания депутатов Кувакинского СП от 18 февраля 2019 года № 53/1. Флаг внесён в Государственный геральдический регистр РФ под № 12342.

Описание флага Кувакинского сельского поселения Алатырского района Чувашской Республики
Прямоугольное полотнище с отношением ширины к длине 2:3, воспроизводящее композицию герба Кувакинского сельского поселения в жёлтом, зелёном и красном цветах.

Обоснование символики герба Кувакинского СП:
Село Кувакино основано в XVI в. как деревня Верхняя Ичикса, сменившая название в 1696 г. переселенцами из с. Кувакино Костромской губернии. С самого начала его возникновения большое развитие получают отхожие промыслы: плотничество, столярное дело, гончарное, бондарное производство. Развивается торговля, которой занимается зажиточная часть населения. И после 1917 г. в селе было 22 мельницы, несколько частных лавок, ведущих торговлю всем необходимым товаром. Жители других сел, – Березовый Майдан, Злобино и Ичиксы, – входящих в состав Кувакинского сельского поселения, также славились своим мастерством. Они занимались производством саней, колес, повозок, судов, клепок, плетением корзин.
Изображение золотой пчелы в композиции герба олицетворяет трудолюбие, хозяйственность, преуспевание, творческие способности жителей поселения.
Ельчатая глава символизирует лесные богатства и легенду о возникновении села Кувакино на месте дремучего леса.
Камень – символ духовной крепости, твердости, подразумевает известных уроженцев этой земли. Они стали примером мужества, героизма, преданности, трудовой доблести, таланта. Герой Советского Союза И.М. Ивкин; военачальник, генерал-майор артиллерии В.Д. Шилов; ученые – В.П. Егоршин, В.А. Стрежнев, А.И. Фиркин; художники – Ф.С. Быков, В.М. Мичурин, Р.Ф. Терюкалова.

Автор – В.А.Шипунов.

По сообщению В. Шипунова