В 2019 году с ликвидацией Серпуховского муниципального района сельское поселение упразднено и вошло в состав городского округа Серпухов. В административном отношении населенные пункты подчинены "городу областного подчинения Серпухов с административной территорией".

Флаг Липицкого сельского поселения разработан творческой группой Союза геральдистов России и принят Решением Совета депутатов СП Липицкое №6/7 от 14 июля 2009 года.

"3. Описание и обоснование символики флага сельского поселения «Липицкое»
3.1. Описание флага сельского поселения «Липицкое»:
«Прямоугольное голубое полотнище с отношением ширины к длине 2:3, воспроизводящее фигуры из герба поселения, выполненные желтыми и оранжевыми цветами».
3.2. Обоснование символики флага сельского поселения «Липицкое».
Первым владельцем села Липицы (административного центра Липицкого сельского поселения) был граф Гавриил Иванович Головкин – первый канцлер Российской империи (высший гражданский чин в Петровской Руси, соответствовавший по табели о рангах воинскому чину генерал-фельдмаршала). Получил он этот титул в 1709 году за свои подвиги на поле Полтавской битвы. Все многочисленное семейство Головкиных служило России на ее пользу. Сам Гавриил Иванович, несмотря на огромное богатство, мало тратил на себя, но постоянно заботился о развитии и процветании своих земель и крестьян.
Фигура льва из герба семейства Головкиных легла в основу флага сельского поселения «Липицкое». Липа, вложенная в лапы шагающего льва, как гласный символ села «Липицкое», символически отражает, что начало развития села, было делом рук графа Головкина. Золотая графская корона надо львом подтверждает возведение Гавриила Ивановича в графы Римской Империи в 1707 году.
Липа – не только гласный символ наименования сельского поселения, но и олицетворение грации, красоты, счастья, здоровья и благоухания. Особо почитаема липа у славянских народов: она ценилась как даритель меда из липового цвета, собираемого пчелами. Цветы липы и ее листья используются и в медицинских целях.
Голубой цвет (лазурь) – символ чести, благородства, духовности и возвышенных устремлений. Голубой цвет – символизирует то, что поселение находиться на правом берегу реки Оки.
Желтый цвет (золото) – символ высшей ценности, величия, великодушия, богатства, урожая.
3.5. Авторская группа:
идея флага: Александр Максимов (Серпуховский район),
Константин Моченов (Химки), Михаил Медведев (Санкт-Петербург);
художник и компьютерный дизайн: Ольга Салова (Москва);
обоснование символики: Вячеслав Мишин (Химки)".

Уже Решением Совета депутатов СП Липицкое № 8/4 от 10 декабря 2009 года прежнее решение (14.7.2009 г.) признано утратившим силу и принято новое Положение о флаге. Но сам флаг не претерпел изменений..

По материалам справочной правовой базы "Гарант" и сайта Союза геральдистов России.

Флаг Липицкого внесен в Государственный геральдический регистр РФ под №6044 .