Флаг Лопухинского сельского поселения разработан авторским коллективом в составе: Башкирова Константина Сергеевича, Карпуниной Виктории Валерьевны, Штейнбах Светланы Юрьевны и утвержден Решением Совета депутатов муниципального образования Лопухинское сельское поселение № 54 от 16 апреля 2015 года.

"Флаг муниципального образования Лопухинское сельское поселение Ломоносовского муниципального района Ленинградской области представляет собой прямоугольное полотнище с отношением ширины флага к длине — 2:3, воспроизводящее композицию герба муниципального образования Лопухинское сельское поселение Ломоносовского муниципального района Ленинградской области в белом, красном и чёрном цветах".

По сообщениям Б. Вольфова и В. Пермякова

Флаг внесён в Государственный геральдический регистр РФ под № 10308.