Центр района - село Малая Пурга. До 2021 года существовало муниципальное образование "Малопургинский район" (муниципальный район). В 2021 году муниципальный район преобразован в муниципальный округ (но в названии округа слово "район" сохранено; район также сохранился и как административно-территориальная единица).

Флаг Малопургинского района утвержден Решением Совета депутатов МО "Малопургинский район" от 14 августа 2014 года № 19-11-211.

Флаг представляет собой прямоугольное полотнище, состоящее из двух равновеликих горизонтальных полос: красного (вверху) и чёрного цветов, в центре которого фигура жёлтого цвета в виде косого, сверху гаммированного вниз, а внизу - в обе стороны креста, выше которого между сторонами креста ромб жёлтого цвета; в крыже - контур прямого равноконечного вырубного креста белого цвета".

Вырубной крест символизирует принадлежность района к Удмуртской Республике. В центре полотнища изображено традиционное украшение женских головных уборов южных удмурток - сюлык, символ божества плодородия, оберег жителей Малопургинского района. Черный цвет - символ земли и стабильности, красный - цвет солнца и жизни, белый - символ космоса и чистоты нравственных устоев, жёлтый - духовное богатство народа.

По сообщению В.Пермякова

Флаг внесён в Государственный геральдический регистр РФ под № 9951.