Флаг МО "Мальжагарский 2-й наслег" утверждён Решением № 18 Совета депутатов МО "Мальжагарский 2-й наслег" от 29 декабря 2014 года. Флаг внесен в Государственный геральдический регистр РФ под № 10802.

1.2. Флаг муниципального образования «Мальжагарский 2-й наслег» представляет собой голубое прямоугольное полотнище с отношением ширины к длине 2:3, воспроизводящее композицию герба муниципального образования «Мальжагарский 2-й наслег» в голубом цвете. В середине флага всадник и лошадь несутся по зеленому лугу, выше восходящее солнце белого цвета.

По сообщению В. Пермякова. Рисунок из архива В. Маркова