Флаг Мечетлинского района утвержден решением Совета муниципального района Мечетлинский район Республики Башкортостан от 12 июля 2006 года № 119. Флаг внесен в Государственный геральдический регистр под №3008, а также - в Государственный регистр символики в Республике Башкортостан под №053. Автор флага - Рафас Хаерзаманов. Рисунок флага (прорисовка сокола) был несколько откорректирован в ходе консультаций со специалистами Геральдического совета. Описание флага:

"Прямоугольное полотнище с соотношением ширины к длине 2:3, состоящее из двух горизонтальных полос: верхней синего цвета шириной 4/5 ширины полотнища и нижней белого цвета; в центре синей полосы взлетающий сокол белого цвета".

Символика герба и флага Мечетлинского района:

Центральной фигурой герба является серебряный взлетающий сокол. Самый древний и крупный род айлинских башкир, живущих и ныне на мечетлинской земле, называется «кошсо». «Кошсо» в переводе с башкирского языка означает «охотник с птицей». Основная часть населения района является потомками этого башкирского рода, и изображение сокола в гербе отражает историческое прошлое района и уважение к памяти предков. Одновременно сокол является геральдическим символом храбрости, ума и красоты.
Легенда гласит: "Давным-давно в этих краях жили великаны и звали их Алпамышами. Они семимильными шагами ходили по горам и долинам, перешагивали через реки, вырывали с корнями большие деревья. Один из таких великанов, проходя по берегам реки Ай, почистил сапоги от прилипшей грязи и образовались на том месте три горы". Эти горы, как ожерелье, охватывают реку. Возможно, поэтому народ назвал эти три горы Мунчуги-муйынса – ожерелье. Контуры трех холмов и серебряные нити, изображенные на гербе района, символизируют три горы Мунчуги и реку Ай.
Изображенное в верхней части герба стилизованное соцветие курая отражает единение, дружбу и согласие народов, проживающих в районе.
Голубой цвет поля герба символизирует красоту, величие, верность, доверие, безупречность, а также развитие, движение вперед и надежду.
Серебряный цвет – символ веры, искренности и благородства.

Материалы сайта Государственного Собрания - Курултая Республики Башкортостан. Текст документа предоставлен В. Марковым