Флаг Михайловского СП утвержден решением Совета Михайловского сельского поселения от 27 августа 2010 года № 48 и внесен в Государственный геральдический регистр РФ под № 6459. Описание флага:

"Прямоугольное желтое полотнище с отношением ширины к длине 2:3, воспроизводящая композицию герба Михайловского сельского поселения в красном, голубом, черном, белом и желтом цвете".
Обоснование символики флага Михайловского сельского поселения .
Флаг разработан на основе герба Михайловского сельского поселения.
Планомерное освоение земель вошедших в состав территории современного муниципального образования началось в 1868 году с основания хутора Красницкого на правом берегу реки Ушед впоследствии, после строительства Михайло-Архангельской церкви, переименованного в село Михайловское.
В настоящее время на территории муниципального образования дружно и мирно проживают представители двадцати национальностей, о чем в гербе символизирует цветок ромашки о двадцати лепестках. Цветок - традиционный символ добра, красоты и любви.
Композиция флага аллегорически отражает уникальные природно-географические особенности, повлиявшие на развитие экономики. Большая часть границы Михайловского поселения проходит по берегу Крюковского водохранилища, водные ресурсы которого позволили создать систему рисовых чеков, дающих стабильно высокие урожаи. Водохранилище обозначено на флаге голубым цветом.
Черный цвет - символ плодородия, в сочетании с рисовыми колосьями отражает в гербе развитое сельское хозяйство как основу экономики муниципального образования.
Желтый цвет (золото) - символ урожая, богатства, стабильности, уважения; цвет спелых нив дополняет сельскохозяйственную символику герба.
Белый цвет (серебро) - символ чистоты, совершенства, мира и взаимопонимания.
Голубой цвет - символ чести, благородства, духовности; цвет водных просторов и бескрайнего неба.
Авторская группа:
идея флага: Николай Ищенко (ст. Дядьковское), Анатолий Раков (Краснодар), Константин Моченов (Химки), Ирина Соколова (Москва);
художники: Николай Ищенко (ст. Дядьковское), Ирина Соколова (Москва);
компьютерный дизайн: Ирина Соколова (Москва);
обоснование символики: Николай Ищенко (ст. Дядьковское), Кирилл Переходенко (Конаково).

По материалам сайта Союза геральдистов России