Центр поселения - хутор Михайлов.

Флаг Михайловского СП утверждён Решением Собрания депутатов № 135 от 30 ноября 2015 года.

3.1. Описание флага Михайловского сельского поселения:
Прямоугольное полотнище с отношением ширины к длине 2:3, воспроизводящее композицию герба Михайловского сельского поселения в желтом, синем и черном цветах.
3.2. Обоснование символики:
- серебряная волнистая перевязь – река Быстрая, по обе стороны которой обосновалось Михайловское сельское поселение.
-  золотой церковный купол - православие, духовность и чистота помыслов жителей поселения
-  шашки - поселение образовали казачьи семьи. Перекрестие шашек образовывает римскую цифру «X», что обозначает  десять семей, которые основали сельское поселение.
- черный цвет - в геральдике символизирует благоразумие и мудрость, скромность и честность. А в данном случае – еще указывает и на большие залежи угля и наличие здесь черноземов.
-  золото - в геральдике символ высшей ценности, величия, прочности, силы, великодушия.
-  золотая корона - приличествует сельскому поселению, не являющемуся центром муниципального района, может использоваться или не использоваться при воспроизведении Герба.
3.3. Авторская группа:
Идея флага: О. Тесля (г. Таганрог).
компьютерный дизайн: О. Дмитриев (г. Таганрог),
обоснование символики: О. Тесля (г. Таганрог).
обоснование символики: О. Тесля (г. Таганрог).

По сообщению В. Пермякова

Флаг внесён в Государственный геральдический регистр РФ под № 10656.