Флаг Мингрельского сельского поселения утвержден Решением Совета Мингрельского сельского поселения Абинского района № 98-с от 25 февраля 2011 года и внесен в Государственный геральдический регистр РФ под № 6852.

"Прямоугольное полотнище с отношением ширины к длине 2:3, воспроизводящее композицию герба Мингрельского сельского поселения в голубом (синем), зелёном, белом, жёлтом и черном цветах".

"Обоснование символики:
Герб и флаг языком символов и аллегорий отражают исторические, культурные и экономические особенности сельского поселения.
Станица Мингрельская основана кубанскими и донскими казаками в 1863 на берегу горной реки Мингрелка. Одновременно со станицей было построено и крепостное укрепление. Через два года, когда необходимость в данном укреплении отпала, казаки, привыкшие к степным просторам, решили это место покинуть. Согласно указу государя-императора Александра II, от 31 июля 1865 все население станицы Мингрельской переселилось на новое место - на реку Аушедз, в степную часть левобережья Кубани.
Серебряный волнистый пояс аллегорически указывает на реки Мингрелка и Аушедз, реки с которыми связана жизнь мингрельцев.
Изображение крепостного укрепления указывает на то, что станица первоначально была основана как укрепление.
Зелёная часть герба символизирует поросшие зеленью верховья реки Мингрелки, где первоначально была расположена станица Мингрельская, а лазоревая (синяя) – современное место расположения станицы Мингрельской и хутора Аушедз, входящего в состав поселения.
Зелёный цвет символизирует жизнь, надежду, здоровье, сельское хозяйство, красоту окружающей природы.
Лазоревый (синий) цвет символизирует чистое небо, безупречность, движение вперед и целеустремленность, настойчивость и упорство.
Основной отраслью сельского хозяйства в поселении является рисоводство, что и отражено изображением метёлок риса. Количество метёлок аллегорически указывает на два населённых пункта в составе поселения.
Изображение казачьих шашек говорит о том, что мингрельцы, как ранее, так и в настоящее время остаются, прежде всего, казаками.
Автор герба, изображение и обоснование символики: В. Нагаевский (Тихорецк).

Источник - сайт "ГЕРАЛЬДИКА.РУ" со ссылкой на М. Шарунова