Флаг Мюрюнского наслега утвержден 16 апреля 2009 года. Обоснование символики флага:

"Флаг представляет прямоугольное полотнище. Синий цвет символизирует чистое небо, олицетворяющее вечность, мир и покой. В левом верхнем углу нарисовано солнце, символизирующее возрождение и надежду. Белый цвет – символ озера Мюрю, также означает знак чистоты и простоты. Холмы и мысы, окружающие озеро Мюрю обозначены коричневым цветом. Зеленый цвет обозначает плодородные луга аласа".

По сообщению Б.Вольфова со ссылкой на сайт Правительства Республики Саха