Сельское поселение Мочильское входило в состав Серебряно-Прудского муниципального района. В октябре 2015 года все муниципальные образования в составе района упразднены и создан "городской округ Серебряные Пруды". Соответственно с 2015 года не действует и бывшая символика СП Мочильское.

Флаг Мочильского с.п. утвержден решением Совета депутатов сельского поселения Мочильское Московской области от 1 февраля 2011 года № 106/18. Флаг внесен в Государственный геральдический регистр РФ под № 6738. Согласно тексту Положения о флаге с.п. Мочильское:

"2. Описание и обоснование символики флага сельского поселения Мочильское
2.1. Описание флага сельского поселения Мочильское:
"Прямоугольное двухстороннее полотнище с отношением ширины к длине 2:3, состоящее из двух равных вертикальных полос: белой и зеленой, поверх линии деления изображен сноп на белой части зеленый, на зеленой — желтым, перевитый лентой обратных цветов. Над снопом изображена желтая звезда о восьми лучах".
2.2. Обоснование символики флага сельского поселения Мочильское.
Флаг разработан на основе герба сельского поселения Мочильское.
Территории, вошедшие в состав сельского поселения Мочильское имеют многовековую историю. По утверждению ученых здесь расположено древнее Мочильское городище, существовавшее до татаро-монгольского нашествия. Село Мочилы — центр сельского поселения, впервые упоминается в XVI столетии в Писцовых книгах.
Желтая восьмиконечная звезда символизирует памятник архитектуры — церковь Рождества Христова, построенную в Мочилах одним из владельцев премьер-майором Яковом Михайловичем Масловым в 1793 году.
Звезда — традиционный символ высоких стремлений, идеала, путеводности, в христианстве звезда один из символов праздника Рождества Христова.
Современное сельское поселение сохраняет традиционный уклад экономики ориентированный на сельскохозяйственное производство. Одним из приоритетных направления является растениеводство, показанное снопом и цветовой гаммой — золотом и зеленым цветом. Перемена цвета снопа с зеленого на золотой аллегорически показывает полный сельскохозяйственный цикл от подготовки полей под посевы до сохранения собранного урожая.
Зерновое хозяйство является основным, на полях сельского поселения главным образом выращивается пшеница. Мочильское поселение — одно из немногих в Московской области, где растет кукуруза, идущая на производство комбинированных кормов для сельскохозяйственных животных.
Желтый цвет (золото) — символ урожая, богатства, стабильности, уважения интеллекта
Зеленый цвет — символ природы, здоровья, молодости, жизненного роста.
Белый цвет (серебро) — символ чистоты, совершенства, мира и взаимопонимания.
Сочетание белого цвета и зеленого на флаге поселения перекликается с цветовой гаммой герба Серебряно-Прудского муниципального района, подчеркивая историческое и территориальное единство двух муниципальных образований.
2.3. Авторская группа:
идея флага: Константин Моченов (Химки), Сергей Янов (п. Малаховка);
художник и компьютерный дизайн: Ирина Соколова (Москва);
обоснование символики: Кирилл Переходенко (Конаково).

По материалам сайта сельского поселения