Флаг Модутского наслега утверждён решением наслежного совета МО "Модутский наслег" от 17 марта 2014 года № 1-21С.

Источник рисунка - сайт Республики Саха (Якутия)

Флаг внесен в Государственный геральдический регистр РФ под № 10208 cо ссылкой на тот же акт. При этом рисунок его несколько упрощён. Описание в свидетельстве ГГР:

"Прямоугольное полотнище с соотношением ширины к длине 2:3, воспроизводящее композицию герба МО "Модутский наслег" в синем, жёлтом, зеленом и белом цветах".

Материалы геральдического архива В. Маркова.