До 2012 года сельское поселение "Мосрентген" входило в состав Ленинского района Московской области. С 1 июля 2012 года вступило в силу Соглашение об изменении границы между субъектами Российской Федерации городом Москвой и Московской областью от 29 ноября 2011 года. К Москве отошли 2 городских округа и 19 городских и сельских поселений на юго-западе Московской области. В том числе и сельское поселение "Мосрентген".

Флаг МО сельское поселение "Мосрентген" утверждён Решением Совета депутатов сельского поселения Мосрентген от 4 февраля 2006 года №4/2 и внесен в Государственный геральдический регистр РФ под №2176. Описание флага:

"Флаг сельского поселения Мосрентген представляет собой прямоугольное красное полотнище с отношением ширины к длине 2:3, с синей полосой в 2/9 полотнища у древка; посередине красной части полотнища – белый грифон с тремя мечами из герба сельского поселения, на полосе – жёлтый крест и белая подкова".

Обоснование символики флага сельского поселения Мосрентген.
Флаг сельского поселения разработан на основе его герба.
Становление и развитие территории муниципального образования сельского поселения "Мосрентген" связаны с деятельностью служилого дворянина Максима Фёдоровича Стрешнева, получившего эти земли в 1628 году в награду за участие в освобождении Москвы от польских интервентов.
Изображение жёлтого (золотого) креста и белой (серебряной) подковы из герба Стрешневых подчёркивают геральдическую и историческую преемственность.
Белый грифон с жёлтыми глазами, клювом, языком и когтями аллегорически показывает тесную связь муниципального образования с гвардейской Севастопольской Краснознамённой мотострелковой дивизией. Изображение грифона перекликается с гербом города Севастополя.
Белые мечи в лапах грифона символизируют надежную защиту Отечества в прошлом, настоящем и будущем.
Красный цвет - символ мужества, воинской доблести, силы.
Голубой цвет - символ чести, благородства, духовности.
Белый цвет (серебро) - символ чистоты, совершенства, мира и взаимопонимания.
Жёлтый цвет (золото) - символ богатства, стабильности, уважения, интеллекта.
Авторская группа:
идея флага: Константин Мочёнов (Химки);
Владислав Кириллов (п. Мосрентген);
обоснование символики: Олег Агафонов (Москва);
художник и компьютерный дизайн: Оксана Афанасьева (Москва)".

По материалам сайта Союза геральдистов России

Решением Совета депутатов поселения "Мосрентген" в городе Москве от 31 августа 2022 года № 62/1 "Об официальных символах (гербе и флаге) поселения "Мосрентген" в городе Москве существующие герб и флаг муниципального образования сельского поселения "Мосрентген" Ленинского муниципального района Московской области признаны в качестве официальных символов поселения "Мосрентген" в городе Москве. Описание флага несколько уточнено:

"2.1. Описание флага поселения «Мосрентген»:
"Прямоугольное красное полотнище с отношением ширины к длине 2:3, с синей полосой в 2/9 полотнища у древка; посередине красной части полотнища – белый с желтыми глазами, клювом, языком и когтями грифон с тремя мечами в ножнах в передних львиных лапах из герба муниципального образования; на синей полосе – жёлтый крест над белой подковой".

По информации В. Маркова (г. Санкт-Петербург)