1 марта 1999 года Городская Дума Муравленко утвердила флаг города.

"Флаг муниципального образования город Муравленко представляет собой голубое полотнище с отношением длины полотнища к ширине 3:2, с двумя опрокинутыми желтыми ключами накрест, переплетенными кольцами (ушками) в крыже, с идущей вдоль нижнего края белой орнаментальной полосой, повторяющей рисунок серебряного орнамента в гербе города Муравленко".

Авторы флага: Юрий Сапаровский (г. Муравленко) и Константин Моченов (г. Химки).

Изображение флага предоставлено М.В.Ревнивцеву начальником отдела информатизации Администрации г.Салехарда И.В.Мельниковым.