Городское поселение Мытищи входило в состав Мытищинского муниципального района. В сентябре 2015 года все муниципальные образования в составе района упразднены и создан "городской округ Мытищи". Соответственно с 2015 года не действует и бывшая символика ГП Мытищи.

Флаг городского поселения Мытищи выполнен на основе районного флага. Флаг и Положение о флаге г.п.Мытищи утверждены Решением №9/5 Совета депутатов городского поселения Мытищи от 28 марта 2006 года "О флаге городского поселения Мытищи Мытищинского муниципального района Московской области".

"Описание флага:
"Флаг городского поселения Мытищи представляет собой прямоугольное полотнище с отношением ширины к длине 2:3, из голубой (4/5 ширины полотнища) и нижней зеленой (1/5 ширины полотнища) горизонтальных полос поверх которых наложен белый акведук с четырьмя опорами и тремя арками; под средней аркой поверх зеленого края - желтая ладья на катках с конской головой на носу; при этом ширина голубой части над акведуком составляет 1/5 ширины полотнища."
Символика флага:
"Древний водный путь, связывавший бассейны рек Яузы и Клязьмы проходил мимо места, где сейчас находится городское поселение Мытищи. С этого места на протяжении 7 километров начинался волок, когда суда перетаскивали с одной речки на другую с помощью круглых бревен. Именно в этом месте был пункт сбора пошлины (мыта) с людей и судов. Место, где собирали мыт, называли "мытище", что нашло отражение в названии города.
На флаге волок отражен ладьей на катках.
Мытищинский край издревле славился прекрасной ключевой водой, которую с помощью акведука (первый в России водопровод) подавали в Москву, что и отражено на флаге.
Синий цвет символизирует мир, чистоту неба, истину, возвышенные устремления и честь.
Зеленый цвет символизирует надежду, плодородие, жизнь, здоровье. Желтый цвет - символ высшей ценности, богатства, прочности, силы, великодушия, солнечного света.
Белый цвет - символ простоты, совершенства, благородства, мира, сотрудничества".
Авторская группа:
идея флага: Герберт Шмидт (Мытищи), Андрей Каменский;
геральдическая доработка: Константин Моченов (Химки), Борис Субботин (Москва);
художник: Роберт Маланичев (Москва);
компьютерный дизайн: Оксана Афанасьева (Москва)".

По материалам сайта города Мытищи

Флаг внесен в Государственный геральдический регистр РФ под №2296.

Решением Совета депутатов ГП Мытищи от 26 апреля 2007 года №22/3 утверждено Положение "Об официальных символах городского поселения Мытищи и порядке их использования". Описание флага сохранено.

Решением Совета депутатов ГП Мытищи от 4 марта 2010 года №7/3 были признаны утратившими силу решения от 28.3.2006 г. и 26.04.2007 г. и утвержено Положение "О гербе и флаге городского поселения Мытищи и о порядке их использования в новой редакции". Описание флага сохранено без изменений.