В XVI веке после завоевания Казанского ханства часть арских татар была насильно обращена в православие, крещёные татары получили название "кряшены". В 1736 году на реке Ик была построена Нагайбакская крепость, в ведение которой были собраны кряшены Уфимского уезда. В 1842 году нагайбакские казаки-кряшены с семьями из Бакалинской и Нагайбакской станиц были переселены в Верхне-Уральский уезд Оренбургской губернии, где заложили поселения на реке Гумбейке, одним из которых был казачий поселок № 3, получивший в 1843 году название Фершампенуаз в честь победы русских войск в 1814 году под городом Фер-Шампенуаз на реке Марне (Франция). При создании в марте 1919 года Автономной Башкирской ССР в её состав из Оренбургской губернии были переданы 12 волостей Верхне-Уральского уезда, оставшаяся часть этого уезда была включена 27 августа 1919 года во вновь созданную Челябинскую губернию. После создания в 1923 году Уральской области нагайбакские поселения входили в состав её Троицкого округа, 4 декабря 1927 года был создан Нагайбакский район с центром в селе Фершампенуаз.

Одновременно с гербом Нагайбакского района Союзом геральдистов России во главе с К.Ф.Мочёновым был разработан флаг Нагайбакского района, утвержденный 28 ноября 2002 года постановлением №50 Нагайбакского районного Совета депутатов и внесенный в Государственный геральдический регистр Российской Федерации за №1111 с официальным описанием:

"Прямоугольное синее полотнище с соотношением ширины к длине 2:3, воспроизводящее гербовую композицию, смещенную к древку: два жёлтых колоса и белый меч, обвитый листьями колосьев"

С любезного разрешения К.Ф.Мочёнова использованы материалы книги: К.Ф.Мочёнов, Г.А.Туник "Официальные символы Челябинской области и муниципальных образований"