Флаг Нефтекамска утвержден решением Совета городского округа город Нефтекамск Республики Башкортостан от 13 июля 2006 года № 1-12/2 и внесен в Государственный регистр символики в Республике Башкортостан с присвоением регистрационного № 033 и в Государственный геральдический регистр Российской Федерации с присвоением регистрационного № 3006. Автор флага - Салават Гилязетдинов. Первоначально расположение "вилообразного креста" было несколько другим (окончательно установлено после консультаций с геральдическим советом).

"Прямоугольное полотнище с соотношением ширины к длине 2:3, воспроизводящее развернутую к древку композицию герба города Нефтекамска в синем, желтом и черном цветах".

"Композиция продиктована особенностями возникновения и экономического развития города Нефтекамска. Центральными элементами являются три ключа, символизирующие развитую промышленность города: энергетику, машиностроение, легкую промышленность. В каждом поле расположены звезды черного цвета с золотыми лучами, символизирующие нефтяные богатства края – основу возникновения и развития города. Три звезды также символизируют город как центр промышленности, образования и культуры северозападного региона Башкортостана. Семь лучей звезды обозначают семь родов, положивших начало единению народов, проживающих на территории Республики Башкортостан. Лазоревый цвет поля символизирует красоту, величие, развитие, движение вперед и надежду. Золотой цвет – символ богатства, справедливости и великодушия. Черный цвет – цвет нефти, одновременно олицетворяет благоразумие и образованность."

Материалы книги "Башкоротостан. Государственные символы и символика городов и районов", Уфа, 2007 г.