Флаг Нижнебаканского СП утвержден Решение Совета муниципального образования Нижнебаканское сельское поселение Крымского района от 2 сентября 2010 года № 41. и внесен в Государственный геральдический регистр РФ под № 6447. Описание флага:

"Прямоугольное полотнище с отношением ширины к длине 2:3, воспроизводящее композицию герба Нижнебаканского сельского поселения в зелёном, жёлтом, синем и белом цветах".

Обоснование символики
Флаг Нижнебаканского сельского поселения Крымского района языком символов и аллегорий отражает исторические, культурные и экономические особенности района.
Зелёная пилообразная (в виде зазубрин) перевязь аллегорически указывает на предгорья Главного Кавказского хребта, у которого расположены земли поселения. Четыре горные вершины указывают на четыре населённых пункта в составе поселения.
Зелёный цвет — символ плодородия, гор и лесов, природного изобилия, спокойствия, здоровья и вечного обновления.
Жёлтый цвет (золото) — символ урожая, богатства, стабильности, уважения и интеллекта, подчёркивает плодородие и достаток Нижнебаканского сельского поселения Крымского района.
Изображение виноградной грозди указывает на богатые виноградниками земли поселения.
Синий цвет символизирует честь, искренность, добродетель, возвышенные устремления.
Изображения фонтана аллегорически указывает на святой источник с чистыми родниковыми водами, находящийся на территории поселения, а также на предприятие по розливу и фасовке природной родниковой воды на базе имеющихся в недрах поселения природных родниковых источников.
Нижняя серебряная, мурованная чёрным (в виде камней) часть аллегорически указывает на недра поселения богатые известняком, цементным мергелем.
Авторский коллектив
Идея флага В. В. Нагаевский, А. В. Раков, М. В. Шарунов
Художник В. В. Нагаевский
Обоснование символики В. В. Нагаевский

Источник: "Википедия"